Obiettivo
The two most fundamental features of molecular recognition are affinity and specificity. The proposed research aims to develop a new methodology for de novo design of small interaction networks not seen in Nature and to generate such networks with predetermined levels of specificity and affinity. In Preliminary Results we developed a methodology to de novo design protein binders of surfaces that have not been structurally characterized in bound form. We used this method to design three experimentally validated medium-affinity binders of the apo form of an acyl carrier protein (ACP), which has no co-crystal structures, demonstrating that interaction design could target a broad range of physicochemically appropriate surfaces. This synthetic network is the first multispecific system (one ACP interacts with three unrelated proteins), which is completely devoid of selective pressures for function other than binding, and will serve as a model to study how high affinity, specificity, and multispecificity might arise from non-interacting proteins. We will develop a multidisciplinary computational/experimental approach to substantially increase the affinity of the ACP to its binders by introducing stabilizing substitutions to residues on either one or both sides of each designed interface. Affinity will be further increased by experimental in vitro selection of higher-affinity variants of the ACP or of its partners. We will additionally erect specificity barriers between the ACP-binder pairs by redesigning the amino acid identities and backbones of interfacial loops. Specificity and affinity are important features in many protein-engineering applications, including the development of protein therapeutics and diagnostics, and the generation of synthetic signaling and metabolic networks. Small networks, such as the ones we produce here, may be future building blocks in these applications.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP7-PEOPLE-2012-CIG
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)
Coordinatore
7610001 Rehovot
Israele
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.