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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Inhalt archiviert am 2024-06-18

From Gene Regulatory Networks to Specification, Differentiation and Morphogenesis in the sea urchin embryo

Ziel

A fundamental challenge in developmental biology is to understand how regulatory networks transform regulatory information into cell fate specification and differentiation. Addressing this challenge requires a comprehensive analysis of the regulatory connections between the transcription factors present in a cell and their regulatory and structural targets through developmental time. The sea urchin aboral ectoderm provides an excellent system to dissect these connections due to its accessibility to quantitative expression studies and the multiple developmental programs executed in this territory. One of these programs drives the differentiation of the entire aboral ectoderm into squamous epithelium and represses neural fate, while other programs define regulatory sub-domains within the aboral ectoderm important to normal morphogenesis of other embryonic territories. These programs depend strongly on the BMP pathway, a highly conserved regulator of ecotdermal patterning. Here we propose to identify the downstream targets of the aboral ectoderm regulatory network and to construct a mechanistic model of the aboral ectoderm specification and differentiation. We will conduct a genome-wide identification of (1) cis-regulatory elements that the aboral ectoderm transcription factors bind to (2) genes that respond to perturbation of the aboral ectoderm transcription factors. The function of identified cis-regulatory elements will be tested using a new high-throughput technology. The expression of key target genes will be perturbed and their effect on the aboral ectoderm morphology and embryogenesis will be studied. Based on this analysis we will construct a mathematical model that simulates the dynamic function of the aboral ectoderm regulatory network. Thus, this project will provide unprecedented understanding of the dynamic regulation of an entire developmental process, from regulatory state establishment to the acquisition of cellular and morphological properties.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

FP7-PEOPLE-2012-CIG
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Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)

Koordinator

UNIVERSITY OF HAIFA
EU-Beitrag
€ 100 000,00
Adresse
ABBA KHUSHY BLVD MOUNT CARMEL
31905 Haifa
Israel

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Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten
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