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Contenuto archiviato il 2024-06-18

From Gene Regulatory Networks to Specification, Differentiation and Morphogenesis in the sea urchin embryo

Obiettivo

A fundamental challenge in developmental biology is to understand how regulatory networks transform regulatory information into cell fate specification and differentiation. Addressing this challenge requires a comprehensive analysis of the regulatory connections between the transcription factors present in a cell and their regulatory and structural targets through developmental time. The sea urchin aboral ectoderm provides an excellent system to dissect these connections due to its accessibility to quantitative expression studies and the multiple developmental programs executed in this territory. One of these programs drives the differentiation of the entire aboral ectoderm into squamous epithelium and represses neural fate, while other programs define regulatory sub-domains within the aboral ectoderm important to normal morphogenesis of other embryonic territories. These programs depend strongly on the BMP pathway, a highly conserved regulator of ecotdermal patterning. Here we propose to identify the downstream targets of the aboral ectoderm regulatory network and to construct a mechanistic model of the aboral ectoderm specification and differentiation. We will conduct a genome-wide identification of (1) cis-regulatory elements that the aboral ectoderm transcription factors bind to (2) genes that respond to perturbation of the aboral ectoderm transcription factors. The function of identified cis-regulatory elements will be tested using a new high-throughput technology. The expression of key target genes will be perturbed and their effect on the aboral ectoderm morphology and embryogenesis will be studied. Based on this analysis we will construct a mathematical model that simulates the dynamic function of the aboral ectoderm regulatory network. Thus, this project will provide unprecedented understanding of the dynamic regulation of an entire developmental process, from regulatory state establishment to the acquisition of cellular and morphological properties.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-2012-CIG
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)

Coordinatore

UNIVERSITY OF HAIFA
Contributo UE
€ 100 000,00
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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