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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Inhalt archiviert am 2024-06-18

High Performance, Cloud and Symbolic Computing in Big-Data problems applied to mathematical modeling of Comparative Genomics

Ziel

Large scale genomics projects exploiting high throughput leading technology have produced and continue to produce massive data sets with exponential growing rates. So far, only a small part of this data can be abstracted, managed and processed, giving an incomplete understanding of the biological process being observed. The lack of processing power is a bottle neck in acquiring results. Comparative genomics is a good example since it includes all the ingredients: huge and ever growing datasets, complex applications that demands large computational resources and new mathematical and statistical models for analysing and synthetizing genomic information. A promising approach to address such massive data sets is the creation of new computer software that makes effective use of parallel processing.
This proposal pursues the linking of different research domains to come up with a coordinated multi-disciplinary approach in the development of tools targeting Big-Data and computationally intensive scientific applications. Generic solutions for Big-Data storage, management, distribution, processing and final analysis will be developed. These solutions will target a broad range of scientific applications, in concrete, as proof-of-concept they will be implemented in the ‘Comparative Genomics’ field of bioinformatics and biomedical domains. Applications such as the detection of main evolutionary events, new comparative genomics’ models that can be evaluated experimentally, for inter-species evolutionary distance, the composition of the k-mers dictionaries for each specie, or customising symbolic computing methods to determine the consensus tree from a sequence of trees with application in multiple sequence alignments, phylogenetic studies, clustering algorithms, etc. present in diverse fields of bioinformatics, from NGS-DNA assembly to gene-expression, all of them well suited applications to apply HPC-CC approaches and with high and attractive potential for commercialization.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

FP7-PEOPLE-2012-IAPP
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

MC-IAPP - Industry-Academia Partnerships and Pathways (IAPP)

Koordinator

UNIVERSIDAD DE MALAGA
EU-Beitrag
€ 403 440,91
Adresse
AVDA CERVANTES, NUM. 2
29016 MALAGA
Spanien

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Region
Sur Andalucía Málaga
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten

Beteiligte (5)

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