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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Inhalt archiviert am 2024-06-18

Biochemical characterization of RNA silencing mechanisms and their alteration by viral proteins in plant cell-free systems

Ziel

Posttranscriptional gene silencing (PTGS) is a form of small (s)RNA-mediated gene regulation with important roles in development, stress responses, and antiviral defense in plants. PTGS effectors, called RNA-induced silencing complexes (RISCs), have ARGONAUTE (AGO) proteins bound to single-stranded (ss) guide sRNAs as core components. RISCs recognize target RNA displaying complementarity to guide sRNAs, and inactivate them by endonucleolytic cleavage (or ‘slicing’) or by slicer-independent translational repression. A precise dissection of the underlying mechanisms has been, however, hampered by a lack of plant cell-free systems allowing reconstruction of key PTGS steps in vitro. Recently, a cell-free AGO1-RISC assembly system was developed in Japan, using extracts from evacuolated tobacco BY-2 protoplasts (BYL) and allowed to establish that AGO1-RISC assembly relies on molecular chaperoning by HSP90 and co-factor CYP40. The proposed project will further deepen the understanding of plant RISC assembly mechanisms and decipher the molecular underpinnings of other PTGS steps including Dicer processing and RISC-mediated translational repression. In parallel, the BYL system will be used to investigate, in a strict comparative manner, the direct targets and modes of action of several plant viral suppressors of RNA silencing (VSRs). These proteins have been studied so far mostly in transgenic plants, where feedback PTGS regulations, intrinsically variable VSR expression levels and indirect effects have led to an inaccurate- and sometimes contradictory- view of their action. BYL will bypass these caveats and improve our knowledge of VSRs on antiviral silencing, but also of PTGS, as VSRs will be used to stabilize transient, and thus far inaccessible forms of protein-protein and protein-RNA complexes. Knowledge on plant cell-free systems implemented via the proposed project will finally contribute to European excellence and competitiveness in the field.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

FP7-PEOPLE-2012-IIF
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Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

MC-IIF - International Incoming Fellowships (IIF)

Koordinator

EIDGENOESSISCHE TECHNISCHE HOCHSCHULE ZUERICH
EU-Beitrag
€ 184 709,40
Adresse
Raemistrasse 101
8092 Zuerich
Schweiz

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Region
Schweiz/Suisse/Svizzera Zürich Zürich
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

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