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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Contenido archivado el 2024-06-18

How can we improve our models of biological macromolecules to reproduce experimental crystallographic X-ray intensities better?

Objetivo

In X-ray structure determination, the R-value reports how well a model agrees with the experimental data. In small molecule crystallography, R-values of 3% are routinely reached. However, for biological macromolecules, R-values are normally around 20%, even when data extend to atomic resolution. This is clear evidence that our current models of macromolecular crystal structures are severely and generally lacking. But what is the difference between our models and reality? And how can we improve our models with this information? Are we extracting enough information from these data? Macromolecular crystals contain large regions of disordered solvent –a soup of ions, buffers, PEG and water– which contribute to the measured reflection intensities. They also affect the ordered macromolecules, which adopt slightly different conformations depending on local environment resulting in an ensemble of similar structures rather than one. Because we cannot determine these features as accurately as we would like, in particular low resolution reflections and phases are difficult to model. Phasing(structure solution) and refinement of macromolecular X-ray structures suffer from this lack of understanding. We aim to improve structure determination and model quality with model-free phases and electron density derived from MAD experiments. New and more sophisticated scale functions and solvent models will be tested; phases obtained by different approaches will be analysed for strengths and weaknesses. Improved phase estimates will result in better models, and hence more reliable biological conclusions; all macromolecular structures will benefit. In particular the structure determination of membrane proteins and large macromolecular complexes will be enhanced, where often only mid-low resolution data are available and the poor phase estimates currently obtainable result in noisy electron density maps. The gained information may also influence other methods such as NMR, SAXS, FEL and EM.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

FP7-PEOPLE-2012-IEF
Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinador

MEDICAL RESEARCH COUNCIL
Aportación de la UE
€ 231 283,20
Dirección
20 Park Crescent
W1B 1AL LONDON
Reino Unido

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Tipo de actividad
Public bodies (excluding Research Organisations and Secondary or Higher Education Establishments)
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

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