Objectif
Interactions between proteins and RNAs regulate processing, localization, decay and translational regulation of mRNAs. Recently, it was revealed that the number of putative RBPs in mammalian cells is about three times larger than appreciated. However, the exposed interaction network was inspected only in a single given state; furthermore the functional gene expression mechanism is yet unknown. In my proposed project, we aim to inspect the differences in global protein-occupancy on mRNAs and identify the critical remodeling in protein-RNA interactions that drives the subcellular localization and translation of mRNAs. Our goal will be to understand the misregulated RNA networks in Amyotrophic-lateral-sclerosis (ALS), a common neuromuscular disorder. We will study mouse and human embryonic stem cells and induced pluripotent stem cells of ALS patients, and brain tissue of mouse ALS models. Protein-RNA interactions will be studied by crosslinking the cells in different biological states, purifying RNPs from different cellular fractions high-throughput sequencing on iCLIP produced libraries, and mRNA translation will be studied with ribosome profiling. The combinatorial statistical inference and state-of-the-art computational approaches will be used to interpret the relevant dynamic RNA networks. This work will aim to reveal how normal and dysfunctional dynamic RNA regulation controls translation in motor neurons.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences médicales et de la santé biotechnologie médicale technologies cellulaires cellule souche
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2012-IEF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
WC1E 6BT LONDON
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.