Ziel
Interactions between proteins and RNAs regulate processing, localization, decay and translational regulation of mRNAs. Recently, it was revealed that the number of putative RBPs in mammalian cells is about three times larger than appreciated. However, the exposed interaction network was inspected only in a single given state; furthermore the functional gene expression mechanism is yet unknown. In my proposed project, we aim to inspect the differences in global protein-occupancy on mRNAs and identify the critical remodeling in protein-RNA interactions that drives the subcellular localization and translation of mRNAs. Our goal will be to understand the misregulated RNA networks in Amyotrophic-lateral-sclerosis (ALS), a common neuromuscular disorder. We will study mouse and human embryonic stem cells and induced pluripotent stem cells of ALS patients, and brain tissue of mouse ALS models. Protein-RNA interactions will be studied by crosslinking the cells in different biological states, purifying RNPs from different cellular fractions high-throughput sequencing on iCLIP produced libraries, and mRNA translation will be studied with ribosome profiling. The combinatorial statistical inference and state-of-the-art computational approaches will be used to interpret the relevant dynamic RNA networks. This work will aim to reveal how normal and dysfunctional dynamic RNA regulation controls translation in motor neurons.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Medizinische Biotechnologie Zelltechnik Stammzelle
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik RNS
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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FP7-PEOPLE-2012-IEF
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
WC1E 6BT LONDON
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.