Objectif
By analyzing the structure of eukaryotic genes it is possible to identify two different sequence types: those that are present in the mature transcript or mRNA, called exons, and those that are not present, called introns. RNA sequences which define exon/intron boundaries, spliceosome components, and splicing factors are represented among all eukaryotes. Besides these similarities there are some differences as intron/exon size, and the number of genes coding serine/arginine -rich (SR) proteins (splicing factors). These make plants ideal systems to study evolutionary conserved strategies for alternative splicing regulation, and to find novel mechanisms.
During my PhD and postdoctoral research, we have shown that a retrograde signal generated in the chloroplast by light modulates alternative splicing. Interestingly, alternative splicing of the SR protein coding gene RS31 is severely affected. This project main goal is to identify the implicated genes, and gene products, in the light retrograde signaling pathway that affect RS31 alternative splicing. To achieve this aim I will generate a reporter construct with the coding sequence for the hygromycin phosphotransferase (Hpt), as selection marker, combined with the alternatively spliced region of RS31. Because of this reporter design, the synthesis of HPT protein would depend on the alternative splicing outcomes of RS31. Only those transgenic lines with higher amounts of alternative splicing isoforms which possess start codons (known as mRNA3 and mRNA2 for RS31) will be hygromycin-resistant. Since the abundance of these isoforms is very low in wild type plants exposed to light, these will be hygromycin sensitive in this condition, while mutants for RS31 alternative splicing would survive. By mutagenizing the transgenic lines genomes and by a further selection using hygromycin, I will be able to isolate alternative splicing regulatory factor mutants, and some of them will be involved in the retrograde signaling pathway.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2012-IIF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
1090 WIEN
Autriche
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.