Objectif
In carcinogenesis epigenetic aberrations occur early, are widespread across the genome and are potentially reversible. DNA methylation (5mC) at gene promoters and CpG islands (CGIs) is well recognized for affecting gene expression. In contrast, little is known on the role of DNA methylation in distal regulatory elements (DREs). Based on recent genome-wide studies, we hypothesize that DREs are more sensitive than CGIs to changes in DNA methylation, thus they may function as primary responders to epigenetic therapies. We previously showed DREs are indeed epigenetically dynamic and prone to demethylation, the process that may involve a newly identified DNA modification, cytosine hydroxymethylation (5hmC). The molecular mechanisms by which these modifications are targeted to specific genomic locations are not well understood.
The project aims to identify the role DNA methylation and hydroxymethylation play in the maintenance and functioning of DREs during cancer progression and treatment. For that, genome-wide methods will be developed for the identification of DREs followed by targeted enrichment using DNA capture array and sequencing. This will allow for simultaneous analysis of 5mC and 5hmC modifications at base-pair resolution. We will examine the effects of virus infection and chronic inflammation on DNA methylation and hydroxymethylation in cultured oral keratinoctes while focusing on the changes in transcription factor binding as a potential targeting mechanism. The effect of DNA methylation inhibitors will be examined to identify key methylation events within DREs required for cancer cell survival. Clinical relevance of the key methylated regions will then be evaluated on a panel of head and neck cancers from well characterized cohorts of patients.
This investigation will reveal important molecular aspects of chromatin function in tumorigenesis, thereby improving prospects for developing personalized cancer therapies that target epigenetic modifications.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie virologie
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2012-CIG
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)
Coordinateur
B15 2TT Birmingham
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.