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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
CORDIS
Contenido archivado el 2024-05-29

Quantitative analysis of genes in single cells

Objetivo

The partners will develop methods and instruments to analyze the copy number of nucleic acid sequences down to the
single cell/single molecule level, with the goal of developing an early diagnosis system for a child disease, namely
hemophagocytic lymphohistiocytosis (HLH). The underlying technique is amplification based counting (ABC), enabling to
quantify the copy number of genetic sequences with a resolution of about 100 base pairs in single cells. ABC is based on
the discovery that there is a strong correlation between the number of positive PCRs from a genetic sequence and the
sequence copy number if the sequence is present only in a few copies per sample. The method provides a resolution
which is much higher than for Fluorescence In Situ Hybridization and works quantitatively with lower sample amounts than
quantitative PCR. To prove ABC's effectiveness for clinical applications the partners will develop a single cell manipulation
unit that picks cells from a solution and transfers them onto an integrated PCR and hybridization slide (AmpliGrid). The
AmpliGrid contains dried-on PCR reagents as well as hybridization probes to detect the presence and specificity of the
PCR products. The single cells on the AmpliGrid will then be processed automatically in an integrated PCR and
hybridization machine (AmpliHyb). Clinical samples will be investigated in which copy number deviations are pathologic
as in genetic diseases. As a model system QuAGSiC chose HLH which is hard to diagnose and fatal without specific
therapeutic measures, as well as trisomy 21 which is relevant in prenatal and postnatal diagnostics. For these applications
the project will cover the complete workflow from identifying the cells of interest to quantifying the copy number of nucleic
acid sequences in clinical samples. Those diseases were selected as they will enable to demonstrate the efficiency of the
proposed diagnostic assay as well as its broad range of applications.'

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

FP6-2005-LIFESCIHEALTH-7
Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

STREP - Specific Targeted Research Project

Coordinador

GENEWAVE
Aportación de la UE
Sin datos
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

Sin datos

Participantes (4)

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