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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
CORDIS
Inhalt archiviert am 2024-05-29

Quantitative analysis of genes in single cells

Ziel

The partners will develop methods and instruments to analyze the copy number of nucleic acid sequences down to the
single cell/single molecule level, with the goal of developing an early diagnosis system for a child disease, namely
hemophagocytic lymphohistiocytosis (HLH). The underlying technique is amplification based counting (ABC), enabling to
quantify the copy number of genetic sequences with a resolution of about 100 base pairs in single cells. ABC is based on
the discovery that there is a strong correlation between the number of positive PCRs from a genetic sequence and the
sequence copy number if the sequence is present only in a few copies per sample. The method provides a resolution
which is much higher than for Fluorescence In Situ Hybridization and works quantitatively with lower sample amounts than
quantitative PCR. To prove ABC's effectiveness for clinical applications the partners will develop a single cell manipulation
unit that picks cells from a solution and transfers them onto an integrated PCR and hybridization slide (AmpliGrid). The
AmpliGrid contains dried-on PCR reagents as well as hybridization probes to detect the presence and specificity of the
PCR products. The single cells on the AmpliGrid will then be processed automatically in an integrated PCR and
hybridization machine (AmpliHyb). Clinical samples will be investigated in which copy number deviations are pathologic
as in genetic diseases. As a model system QuAGSiC chose HLH which is hard to diagnose and fatal without specific
therapeutic measures, as well as trisomy 21 which is relevant in prenatal and postnatal diagnostics. For these applications
the project will cover the complete workflow from identifying the cells of interest to quantifying the copy number of nucleic
acid sequences in clinical samples. Those diseases were selected as they will enable to demonstrate the efficiency of the
proposed diagnostic assay as well as its broad range of applications.'

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

FP6-2005-LIFESCIHEALTH-7
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

STREP - Specific Targeted Research Project

Koordinator

GENEWAVE
EU-Beitrag
Keine Daten
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten

Beteiligte (4)

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