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CORDIS - Risultati della ricerca dell’UE
CORDIS
Contenuto archiviato il 2024-05-29

Quantitative analysis of genes in single cells

Obiettivo

The partners will develop methods and instruments to analyze the copy number of nucleic acid sequences down to the
single cell/single molecule level, with the goal of developing an early diagnosis system for a child disease, namely
hemophagocytic lymphohistiocytosis (HLH). The underlying technique is amplification based counting (ABC), enabling to
quantify the copy number of genetic sequences with a resolution of about 100 base pairs in single cells. ABC is based on
the discovery that there is a strong correlation between the number of positive PCRs from a genetic sequence and the
sequence copy number if the sequence is present only in a few copies per sample. The method provides a resolution
which is much higher than for Fluorescence In Situ Hybridization and works quantitatively with lower sample amounts than
quantitative PCR. To prove ABC's effectiveness for clinical applications the partners will develop a single cell manipulation
unit that picks cells from a solution and transfers them onto an integrated PCR and hybridization slide (AmpliGrid). The
AmpliGrid contains dried-on PCR reagents as well as hybridization probes to detect the presence and specificity of the
PCR products. The single cells on the AmpliGrid will then be processed automatically in an integrated PCR and
hybridization machine (AmpliHyb). Clinical samples will be investigated in which copy number deviations are pathologic
as in genetic diseases. As a model system QuAGSiC chose HLH which is hard to diagnose and fatal without specific
therapeutic measures, as well as trisomy 21 which is relevant in prenatal and postnatal diagnostics. For these applications
the project will cover the complete workflow from identifying the cells of interest to quantifying the copy number of nucleic
acid sequences in clinical samples. Those diseases were selected as they will enable to demonstrate the efficiency of the
proposed diagnostic assay as well as its broad range of applications.'

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP6-2005-LIFESCIHEALTH-7
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

STREP - Specific Targeted Research Project

Coordinatore

GENEWAVE
Contributo UE
Nessun dato
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

Partecipanti (4)

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