Objetivo
Computational RNA structure prediction is currently limited to secondary structure at the exception of few attempts to predict its 3D conformation. Thus, the problem of predicting the structure of RNA is still unsolved and is part of a major challenge in structural biology: to derive the rules of RNA molecular evolution.
This proposal focus on characterizing the underlying principles for comparative modeling of RNA structures at atomic resolution, implementing those principles in a method for comparative modeling, and illustrating its utility. RNA is more like a protein than a DNA because the size, complexity and specific detail of its structure determine its function.
Protein comparative modeling is possible because structure is evolutionary more conserved than sequence and because the relationship between sequence and structure can be quantified. At the same time, the number of available protein structures is increasing and sufficient for the derivation of statistical rules for comparative modeling. These requirements are currently meet for comparative modeling of RNA structures.
Thus, the challenge for structural computational biologists is to derive the basis for developing an automated, accurate and readily available method for comparative modeling of RN A structures at atomic resolution. The result of this proposal should be such a method, which will be implemented in the MODELLER program currently used at more than 6,000 research institutions worldwide.
The application of the method to a large-scale prediction will increase the number of available structures of RNA molecules. Thus, advancing our fundamental knowledge of the relationship between sequence, structure and function of RNA molecules.
This is likely to impact various fields of biomedicine, including but not limited to the design of new drugs to interact with RNA molecules and the study of RNA molecules that regulate cellular processes
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN
- ciencias naturales ciencias biológicas biología molecular evolución molecular
- ciencias naturales ciencias biológicas biología molecular biología estructural
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP6-2004-MOBILITY-12
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Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
IRG - Marie Curie actions-International re-integration grants
Coordinador
VALENCIA
España
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.