Ziel
Computational RNA structure prediction is currently limited to secondary structure at the exception of few attempts to predict its 3D conformation. Thus, the problem of predicting the structure of RNA is still unsolved and is part of a major challenge in structural biology: to derive the rules of RNA molecular evolution.
This proposal focus on characterizing the underlying principles for comparative modeling of RNA structures at atomic resolution, implementing those principles in a method for comparative modeling, and illustrating its utility. RNA is more like a protein than a DNA because the size, complexity and specific detail of its structure determine its function.
Protein comparative modeling is possible because structure is evolutionary more conserved than sequence and because the relationship between sequence and structure can be quantified. At the same time, the number of available protein structures is increasing and sufficient for the derivation of statistical rules for comparative modeling. These requirements are currently meet for comparative modeling of RNA structures.
Thus, the challenge for structural computational biologists is to derive the basis for developing an automated, accurate and readily available method for comparative modeling of RN A structures at atomic resolution. The result of this proposal should be such a method, which will be implemented in the MODELLER program currently used at more than 6,000 research institutions worldwide.
The application of the method to a large-scale prediction will increase the number of available structures of RNA molecules. Thus, advancing our fundamental knowledge of the relationship between sequence, structure and function of RNA molecules.
This is likely to impact various fields of biomedicine, including but not limited to the design of new drugs to interact with RNA molecules and the study of RNA molecules that regulate cellular processes
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik DNS
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik RNS
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Molekularbiologie molekulare Evolution
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Molekularbiologie Strukturbiologie
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
FP6-2004-MOBILITY-12
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
IRG - Marie Curie actions-International re-integration grants
Koordinator
VALENCIA
Spanien
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.