Obiettivo
Computational RNA structure prediction is currently limited to secondary structure at the exception of few attempts to predict its 3D conformation. Thus, the problem of predicting the structure of RNA is still unsolved and is part of a major challenge in structural biology: to derive the rules of RNA molecular evolution.
This proposal focus on characterizing the underlying principles for comparative modeling of RNA structures at atomic resolution, implementing those principles in a method for comparative modeling, and illustrating its utility. RNA is more like a protein than a DNA because the size, complexity and specific detail of its structure determine its function.
Protein comparative modeling is possible because structure is evolutionary more conserved than sequence and because the relationship between sequence and structure can be quantified. At the same time, the number of available protein structures is increasing and sufficient for the derivation of statistical rules for comparative modeling. These requirements are currently meet for comparative modeling of RNA structures.
Thus, the challenge for structural computational biologists is to derive the basis for developing an automated, accurate and readily available method for comparative modeling of RN A structures at atomic resolution. The result of this proposal should be such a method, which will be implemented in the MODELLER program currently used at more than 6,000 research institutions worldwide.
The application of the method to a large-scale prediction will increase the number of available structures of RNA molecules. Thus, advancing our fundamental knowledge of the relationship between sequence, structure and function of RNA molecules.
This is likely to impact various fields of biomedicine, including but not limited to the design of new drugs to interact with RNA molecules and the study of RNA molecules that regulate cellular processes
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA
- scienze naturali scienze biologiche biologia molecolare evoluzione molecolare
- scienze naturali scienze biologiche biologia molecolare biologia strutturale
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP6-2004-MOBILITY-12
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
IRG - Marie Curie actions-International re-integration grants
Coordinatore
VALENCIA
Spagna
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.