Objectif
Computational RNA structure prediction is currently limited to secondary structure at the exception of few attempts to predict its 3D conformation. Thus, the problem of predicting the structure of RNA is still unsolved and is part of a major challenge in structural biology: to derive the rules of RNA molecular evolution.
This proposal focus on characterizing the underlying principles for comparative modeling of RNA structures at atomic resolution, implementing those principles in a method for comparative modeling, and illustrating its utility. RNA is more like a protein than a DNA because the size, complexity and specific detail of its structure determine its function.
Protein comparative modeling is possible because structure is evolutionary more conserved than sequence and because the relationship between sequence and structure can be quantified. At the same time, the number of available protein structures is increasing and sufficient for the derivation of statistical rules for comparative modeling. These requirements are currently meet for comparative modeling of RNA structures.
Thus, the challenge for structural computational biologists is to derive the basis for developing an automated, accurate and readily available method for comparative modeling of RN A structures at atomic resolution. The result of this proposal should be such a method, which will be implemented in the MODELLER program currently used at more than 6,000 research institutions worldwide.
The application of the method to a large-scale prediction will increase the number of available structures of RNA molecules. Thus, advancing our fundamental knowledge of the relationship between sequence, structure and function of RNA molecules.
This is likely to impact various fields of biomedicine, including but not limited to the design of new drugs to interact with RNA molecules and the study of RNA molecules that regulate cellular processes
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences naturelles sciences biologiques biologie moléculaire évolution moléculaire
- sciences naturelles sciences biologiques biologie moléculaire biologie structurale
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP6-2004-MOBILITY-12
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
IRG - Marie Curie actions-International re-integration grants
Coordinateur
VALENCIA
Espagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.