Ziel
Development of genome wide tools to study regulatory elements is particularly important to understand how gene expression is controlled in the human genome. The rational study of transcription factors and DNA-binding proteins in sequenced human genome is critical for making the genome sequences maximally useful.
Chromatin Immuno-Precipitation (ChIP) materials analysed on microarrays for specific interactions (ChIP-chip) is a rapidly emerging technology in the study of DNA binding regulation proteins. A major current limitation of this technology is the lack of high quality antibodies proven to work.
Therefore, the use of an appropriate approach to produce high specific functional binding agents for high throughput functional genomic studies by ChIP-chip is crucial. The present proposal implements an approach for single-step purification of transcription factor and DNA-binding protein complexes based on specific in vivo biotinylation.
For this purpose the humanized (codon optimized) bacterial BirA biotin ligase and the target proteins of interest tagged with a biotin acceptor domain of 13 amino acid residue will be co-expressed in mammalian cells. This will provide the high-specific immuno-precipitation of in vivo biotinylated proteins with their DNA binding sites by strong biotinstreptavidin interaction.
This approach can be scaled up and can serve as the basis for successful genome wide studies. Through the use of this powerful assay important biological questions will find response. By accelerating the ChIP-c hip studies, this approach will help to better understand the gene regulation.
By identifying the DNA sequences reacting with regulatory proteins this approach will help to make the genome sequences maximally useful for further studies and classification, which will accelerate the global genome analysis.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik DNS
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Naturwissenschaften Chemiewissenschaften organische Chemie Amine
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Chromosom
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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FP6-2005-MOBILITY-5
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
GLASGOW
Vereinigtes Königreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.