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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-05-29

Membrane protein structure prediction based on ROSETTA

Objectif

Integral helical membrane proteins constitute about 20% of all proteins encoded by most genomes and they play crucial role in cell function and communication. In addition, the medical importance of membrane bound receptors, channels, and pumps as targets f or drugs are well established.

However, several experimental reasons makes it difficult to obtain the structure of membrane proteins, only 0.6% (168 out of 28,000) of the solved protein structures in the Protein Data Bank (PDB) are membrane proteins. This highlights the need for better and more accurate theoretical structure prediction methods for membrane proteins.

Recently, there has been significant progress in structure prediction of globular proteins from sequence (de novo prediction), offering some hope that structure prediction methodology may be able to contribute to the understanding membrane protein structure.

In this project, currently the best method to predict the structure of non-membrane proteins, the ROSETTA de novo structure prediction method, will be adapted and optimized to predict the three-dimensional structure of membrane proteins.

This project has the potential to significantly enhance the accuracy of the current structural models of membrane proteins (today mostly restricted to 2D topology maps).

It also has the potential to provide fundamentally new insights of high biological and biomedical relevance. From a European perspective there is a chance to acquire expertise in an area of key importance in the future.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP6-2005-MOBILITY-6
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

OIF - Marie Curie actions-Outgoing International Fellowships

Coordinateur

STOCKHOLM UNIVERSITY
Contribution de l’UE
Aucune donnée
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée

Participants (1)

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