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Contenuto archiviato il 2024-06-16

Virtual screening applied to chemogenomics and protein annotation

Obiettivo

Since the completion of the human and other organisms' genome sequence, many new druggable targets are expected to be identified by structural genomics with the expectation of developing new therapeutics. One of the bottlenecks of this drug discovery process is the difficulties encountered to understand the function of these new proteins. So far, much emphasis has been given to bioinformatics: the genomes are annotated using sequence analysis or structural modelling. However, these methods are not always applicable or relevant.

This proposal suggests to investigate methods derived from chemoinformatics. Specifically, chemogenomics implies that the function of a protein can be derived from the structure of the sets of ligands that bind to it. By comparing the pair-wise similarity of these sets of compounds to random distributions, statistical models can be used to compute scores between pairs of sets. These scores are then used to build chemical relationship maps, i.e. ontology of the ligands. These maps could be used alternatively or complementarily to other classifications to annotate the genomes.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP6-2005-MOBILITY-6
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

OIF - Marie Curie actions-Outgoing International Fellowships

Coordinatore

UNIVERSITé DE STRASBOURG
Contributo UE
Nessun dato
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

Partecipanti (1)

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