Obiettivo
MHC class I molecules present peptides from intracellular antigens to the immune system. The peptides are produced by the intracellular proteasome and further trimmed and destroyed by various unrelated peptidases. Only a fraction (0.01%) of these peptides escape peptidase destruction through import into the ER by the peptide transporter TAP before they can bind to resident MHC class I molecules for presentation at the plasma membrane. Since the peptidase activity plays an important role in the selection of peptides for presentation, we propose to study these using microinjection of internally quenched peptides and inhibitors, to measure peptidase activity in living cells.
I aim to: 1. Test with a large set of internally quenched peptides the subspecializati on of intracellular peptidases for substrate (peptide) length and sequence. 2. Identify the respective peptidases responsible for the detected subspecializations. Chemical inhibitors and RNAi for TOP, BH and TPPII have been defined and their effects on pep tide destruction will be measured. 3. Test the effect of the peptidases on the petpidome as presented by MHC class I molecules. Peptidases will be inhibited and the resulting peptidome will be assayed by comparative mass spectrometry using differently labelled amino acids. 4. Test whether different cells employ different peptidase activities. The Neefjes lab has indications that dendritic cells change their peptidase activity and I will study this and the effect of various activation stages of these cells in more detail. 5. Combine these findings with the results on manipulation for peptidase activity to determine the effect of peptidase activity on the outcome of MHC class I response in dendritic cells.
The experiments should reveal the role of cytosolic peptidase activities in antigen presentation by MHC class I molecules and add information to better predict the MHC class I peptidome on the basis of the primary sequence of the antigen.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze mediche e della salute medicina clinica oncologia cancro della pelle melanoma
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze mediche e della salute medicina di base immunologia
- scienze naturali scienze chimiche chimica organica ammine
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP6-2005-MOBILITY-5
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
AMSTERDAM
Paesi Bassi
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.