Objectif
Glycosaminoglycans (GAGs) are polysulfated linear polysaccharides with a wide range of biological functions, including a key role in the immune response. Protein-GAG interactions are mostly electrostatic in nature, mediated by contacts between the negative ly charged groups of GAGs and positively charged amino acid side-chains. Consequently, oligosaccharides in protein-GAG complexes do not occupy hydrophobic pockets, but sit on the protein surface with only a few intermolecular contacts, making conformational analysis and binding studies challenging. Despite their biological significance, at present an atomic level of detail for protein-heparin complexes is provided by a limited number of crystal structures and NMR studies (where heparin is used as a model fo r more-heterogeneous GAGs), whilst the experimental conformations of free GAGs in solution have been exclusively obtained by NMR.
These studies suggest that typically 4-6 carbohydrate rings are in close contact with the protein surface and in the majority of cases, helical conformations very close to those found for free heparin in solution are preserved. However, models of GAG-protein complexes are emerging that involve much longer chains and/or their interactions spanning several protein subunits. Two approaches to the selective chemical functionalisation (tagging) of GAGs will be used by the EIF Fellow; using new synthetic methodology recently developed at Edinburgh.
In the first, the dual introduction of fluorescent labels will allow conformational studies of GAGs in solution, and bound to proteins, by time-resolved fluorescence resonance energy transfer (TR-FRET). In the second, the attachment of paramagnetic moieties to either the reducing, or non-reducing, end of GAGs, and observation of the effect of this on protein atoms by NMR, will allow distances between the two molecules to be inferred and the binding position of the GAG oligosaccharide on a protein surface to be determined.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- ingénierie et technologie ingénierie des materiaux cristaux
- sciences médicales et de la santé médecine clinique ophtalmologie
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule glucides
- sciences naturelles sciences chimiques chimie organique amines
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines enzyme
Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction
Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP6-2005-MOBILITY-5
Voir d’autres projets de cet appel
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
EDINBURGH
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.