Obiettivo
Glycosaminoglycans (GAGs) are polysulfated linear polysaccharides with a wide range of biological functions, including a key role in the immune response. Protein-GAG interactions are mostly electrostatic in nature, mediated by contacts between the negative ly charged groups of GAGs and positively charged amino acid side-chains. Consequently, oligosaccharides in protein-GAG complexes do not occupy hydrophobic pockets, but sit on the protein surface with only a few intermolecular contacts, making conformational analysis and binding studies challenging. Despite their biological significance, at present an atomic level of detail for protein-heparin complexes is provided by a limited number of crystal structures and NMR studies (where heparin is used as a model fo r more-heterogeneous GAGs), whilst the experimental conformations of free GAGs in solution have been exclusively obtained by NMR.
These studies suggest that typically 4-6 carbohydrate rings are in close contact with the protein surface and in the majority of cases, helical conformations very close to those found for free heparin in solution are preserved. However, models of GAG-protein complexes are emerging that involve much longer chains and/or their interactions spanning several protein subunits. Two approaches to the selective chemical functionalisation (tagging) of GAGs will be used by the EIF Fellow; using new synthetic methodology recently developed at Edinburgh.
In the first, the dual introduction of fluorescent labels will allow conformational studies of GAGs in solution, and bound to proteins, by time-resolved fluorescence resonance energy transfer (TR-FRET). In the second, the attachment of paramagnetic moieties to either the reducing, or non-reducing, end of GAGs, and observation of the effect of this on protein atoms by NMR, will allow distances between the two molecules to be inferred and the binding position of the GAG oligosaccharide on a protein surface to be determined.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- ingegneria e tecnologia ingegneria dei materiali cristalli
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
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FP6-2005-MOBILITY-5
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
EDINBURGH
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.