Cel
Glycosaminoglycans (GAGs) are polysulfated linear polysaccharides with a wide range of biological functions, including a key role in the immune response. Protein-GAG interactions are mostly electrostatic in nature, mediated by contacts between the negative ly charged groups of GAGs and positively charged amino acid side-chains. Consequently, oligosaccharides in protein-GAG complexes do not occupy hydrophobic pockets, but sit on the protein surface with only a few intermolecular contacts, making conformational analysis and binding studies challenging. Despite their biological significance, at present an atomic level of detail for protein-heparin complexes is provided by a limited number of crystal structures and NMR studies (where heparin is used as a model fo r more-heterogeneous GAGs), whilst the experimental conformations of free GAGs in solution have been exclusively obtained by NMR.
These studies suggest that typically 4-6 carbohydrate rings are in close contact with the protein surface and in the majority of cases, helical conformations very close to those found for free heparin in solution are preserved. However, models of GAG-protein complexes are emerging that involve much longer chains and/or their interactions spanning several protein subunits. Two approaches to the selective chemical functionalisation (tagging) of GAGs will be used by the EIF Fellow; using new synthetic methodology recently developed at Edinburgh.
In the first, the dual introduction of fluorescent labels will allow conformational studies of GAGs in solution, and bound to proteins, by time-resolved fluorescence resonance energy transfer (TR-FRET). In the second, the attachment of paramagnetic moieties to either the reducing, or non-reducing, end of GAGs, and observation of the effect of this on protein atoms by NMR, will allow distances between the two molecules to be inferred and the binding position of the GAG oligosaccharide on a protein surface to be determined.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- inżynieria i technologia inżynieria materiałowa kryształy
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna okulistyka
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki węglowodany
- nauki przyrodnicze nauki chemiczne chemia organiczna aminy
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka enzymy
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
FP6-2005-MOBILITY-5
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Koordynator
EDINBURGH
Zjednoczone Królestwo
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.