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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Contenido archivado el 2024-05-29

A SNP and haplotype map for the rat

Objetivo

Inherited differences in DNA sequence contribute to phenotypic variation, influencing an individual's risk of disease and response to the environment. A central goal of genetics is to pinpoint the DNA variants that contribute most significantly to variation in each trait. The rat is an important model organism for systems biology, provides the most relevant models of common multifactorial human disease, and it is by far the leading model species in pharmacology and toxicology. It has been the major model for physiological investigation, providing a body of data on patho-physiology, including detailed mechanistic, biochemical and metabolic characterisation that cannot be replaced by other models. Decades of exquisite phenotyping and detailed analysis of crosses of inbred rats have resulted in initial localization of hundreds of loci involved in complex disease and quantitative phenotypes, but with very few eventual gene identifications to date. A clear understanding of the origin and structure of genetic variation in the rat will provide a key missing piece of this puzzle. To fully realize the power of the recent rat genome sequence, we propose to initiate the complete genetic dissection of the ancestral segments making up the most commonly used inbred lines. The proposed SNP based haplotype map provides a valuable tool for functional genomics, specifically by focussing positional cloning of QTLs through:
i) the reduction of regions obtained through linkage analysis via identification of segments shared by the strains used for the cross;
ii) the selection of ideal strain combinations for further reduction of critical regions through simple intercross/backcross experiments;
iii) the use of correlation between phenotype and ancestral sequence origin across many inbred strains to identify very short genomic regions most likely to harbor responsible genes.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

FP6-2003-LIFESCIHEALTH-I
Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

STREP - Specific Targeted Research Project

Coordinador

MAX-DELBRÜCK-CENTRUM FÜR MOLEKULARE MEDIZIN
Aportación de la UE
Sin datos
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

Sin datos

Participantes (7)

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