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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-05-29

A SNP and haplotype map for the rat

Objectif

Inherited differences in DNA sequence contribute to phenotypic variation, influencing an individual's risk of disease and response to the environment. A central goal of genetics is to pinpoint the DNA variants that contribute most significantly to variation in each trait. The rat is an important model organism for systems biology, provides the most relevant models of common multifactorial human disease, and it is by far the leading model species in pharmacology and toxicology. It has been the major model for physiological investigation, providing a body of data on patho-physiology, including detailed mechanistic, biochemical and metabolic characterisation that cannot be replaced by other models. Decades of exquisite phenotyping and detailed analysis of crosses of inbred rats have resulted in initial localization of hundreds of loci involved in complex disease and quantitative phenotypes, but with very few eventual gene identifications to date. A clear understanding of the origin and structure of genetic variation in the rat will provide a key missing piece of this puzzle. To fully realize the power of the recent rat genome sequence, we propose to initiate the complete genetic dissection of the ancestral segments making up the most commonly used inbred lines. The proposed SNP based haplotype map provides a valuable tool for functional genomics, specifically by focussing positional cloning of QTLs through:
i) the reduction of regions obtained through linkage analysis via identification of segments shared by the strains used for the cross;
ii) the selection of ideal strain combinations for further reduction of critical regions through simple intercross/backcross experiments;
iii) the use of correlation between phenotype and ancestral sequence origin across many inbred strains to identify very short genomic regions most likely to harbor responsible genes.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP6-2003-LIFESCIHEALTH-I
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

STREP - Specific Targeted Research Project

Coordinateur

MAX-DELBRÜCK-CENTRUM FÜR MOLEKULARE MEDIZIN
Contribution de l’UE
Aucune donnée
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée

Participants (7)

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