Objectif
Reverse vaccinology (RevVac) is an emerging field that uses bioinformatics to identify vaccine candidates directly from the genome sequence of pathogenic bacteria. The long-term goal of the proposed research is to identify new vaccine candidates that may be formulated into subunit vaccines that protect against bacterial pathogens. The objective of this particular application is to dramatically improve upon methods of RevVac developed in my laboratory. The central hypothesis is that my RevVac procedure will be enhanced by building larger training data sets, incorporating new protein annotation, assessing multiple machine learning methods, investigating additional validation techniques, and by facilitating open access to predicted vaccine candidates to the vaccine community through the Bacterial Protective Antigen Database (BPAD).
Guided by published preliminary data in the journal Vaccine, my hypothesis will be tested by pursuing the following objectives: (1) To improve the prediction of vaccine candidates, (2) To understand what makes a bacterial protein a good vaccine candidate, and (3) To create a vaccine resource for bacteriologists. The rationale for the proposed research is that once there is high confidence in predicted vaccine candidates, then only a small number will need to be tested in animal models in order to identify those with protective effects that can be formulated into subunit vaccines.
This proposal is responsive to the objectives of the work programme since it will establish my novel research talents and knowledge with respect to reverse vaccinology and gene expression biomarker analysis in the EU. In addition, I will bring a plethora of longstanding collaborations solidified while working in the USA. Finally, the University of Southampton is fully committed to my long-term EU integration vaccinology (RevVac) is an emerging field that uses bioinformatics to identify vaccine candidates directly from the genome sequence of pathogenic bacteria.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/fr/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie produit pharmaceutique vaccins
- sciences naturelles informatique et science de l'information intelligence artificielle apprentissage automatique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2013-CIG
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)
Coordinateur
SO17 1BJ Southampton
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.