Objectif
In the protein universe, 30 to 50% of proteins self-assemble to form symmetrical complexes consisting of multiple copies of themselves, called homomers. A peculiarity of homomers is that any mutation is necessarily repeated in all subunits. In a symmetric dimer for example, any mutation of one copy is also found in the second identical copy. Depending where the mutation occurs on the surface, the repetitions of the mutation may or may not be “synergistic”, i.e. participate together to the formation of a new self-interaction. We propose that the consequences of a mutation depend mainly on two factors: (i) its location on the homomer’s surface, which influences its synergy and (ii) the symmetry type of the homomer. We anticipate that these two factors are tightly coupled to the probability that a random mutation triggers the infinite polymerization and aggregation of a homomer. We thus propose a two-pronged approach to analyze this question. (i) In silico, using homomers of known three-dimensional structure, we will infer a “risk factor” for every surface residue, reflecting its probability to be associated with polymerization. We anticipate that high-risk residues are, together with their environment, under pressure to avoid un-wanted interactions. We also anticipate those sites to be under stronger evolutionary constraints. (ii) In vivo, we will artificially introduce amino acid substitutions in homomers at sites that are at high or low-risk, and quantify the potential of these mutations to trigger aggregation or polymerization of the homomer. This project, which combines both theoretical and experimental biology, will help us unveil new basic physico-chemical properties of proteins and of their potential to form unwanted aggregates in cells. This knowledge will contribute to our better understanding of important diseases involving uncontrolled self-association of proteins, such as Parkinson’s, Alzheimer’s, Huntingdon’s, or the sickle cell disease.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale neurologie démence alzheimer
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
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- sciences naturelles sciences chimiques chimie organique amines
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2013-CIG
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)
Coordinateur
7610001 Rehovot
Israël
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.