Obiettivo
Many biological systems at cellular level consist of a high number of elements interacting in complex patterns. These systems often exhibit emergent behaviours that cannot be detected by reductionist approaches. Systems biology is the interdisciplinary methodology aiming at understanding the dynamics of life by determining how the elements of a biological system interact to form functional networks. This research proposal intends to make to advance the state-of-the-art in systems biology by making systematic use of formal models, and more precisely of the Petri nets formalism.
The research will focus on the network of interactions involved in the protein synthesis in Saccharomyces cerevisiae, a species of yeast. The overall goal of the proposal is to optimize the recombinant protein synthesis in this organism. This goal is to be achieved by means of three primary objectives: 1) to formally model the recombinant protein synthesis mechanism; 2) to analyse the obtained model by using formal methods; 3) to control the system behaviour to maximize the recombinant protein synthesis.
The Petri net to be designed will model the different events taking place in the protein synthesis mechanism: transcription, translation, modification, transportation, degradation and secretion. The analysis of the Petri net will consider structural and dynamical properties, and special attention will be paid to the computation of throughput bounds and bottleneck identification. As bottlenecks constrain the throughput of the whole system, any control action aiming at maximizing the protein synthesis will be performed on them.
Overall, this proposal intends to improve our understanding of the cellular mechanism regulating protein synthesis by providing mathematical modelling and analysis tools. This understanding will eventually enable us to control and optimize the synthesis of recombinant proteins, which are broadly used for vaccines, diagnostic tools and therapeutic purposes.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP7-PEOPLE-2013-IEF
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
CB2 1TN CAMBRIDGE
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.