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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-06-18

Multi-phenotype Analysis of Rare Variants – devELopment of an analysis method and software with implementation to large-scale data to unravel pleiotropic genetic effects behind cardiometabolic traits

Objectif

The obesity rates are rapidly increasing worldwide concomitantly with rising prevalence of chronic diseases, including cardiovascular disease and type 2 diabetes. Individual trait genome-wide association studies of common variants (minor allele frequency, MAF>5%) have highlighted complex genetic relationships between related cardiometabolic phenotypes with an intriguing pattern of associated overlapping DNA sequence variant effects, which does not always follow the epidemiological correlations. Joint analysis of multiple correlated traits: (i) increases power for variant discovery; and (ii) facilitates dissection of the genetic mechanisms underlying multi-phenotype association signals, including evaluation of the evidence for pleiotropy. Multi-phenotype analysis methods for common variants have been proposed, however, with the current focus being in low-frequency and rare variants (MAF<5%/1%), novel method development for identification of such effects is required. The project has three goals:
1) To develop a multi-phenotype analysis method for rare variants and to test it on at least 20000 individuals directly available to me. The availability of high-throughput “omics” data, including sequencing data and serum metabolites, adds further challenges to the methods development, e.g. due to genotype uncertainty and hundreds of correlated traits. I will extend the methodological development to the methods for meta-analysis of rare variants, given the need to combine genetic effects across many individual studies;
2) To create an efficient publicly available software tool for the developed methods;
3) To dissect the genetic architecture behind cardiometabolic phenotypes by conducting a large-scale multi-phenotype meta-analysis of rare variant effects on metabolic traits within international consortia. This timely and highly relevant project will allow me to embark on an independent academic career in the field of statistical genetics where my research interests lie.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP7-PEOPLE-2013-IEF
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinateur

IMPERIAL COLLEGE OF SCIENCE TECHNOLOGY AND MEDICINE
Contribution de l’UE
€ 221 606,40
Adresse
SOUTH KENSINGTON CAMPUS EXHIBITION ROAD
SW7 2AZ London
Royaume-Uni

Voir sur la carte

Région
London Inner London — West Westminster
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

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