Objectif
Many important protein families such as signaling receptors, ion channels, structural proteins and enzymes are embedded in the membrane of cells. Despite their importance, understanding of their structure, dynamics and interactions lacks behind that of soluble proteins due to their hydrophobic nature which makes them difficult to study experimentally. We propose to recruit and retain in the Division of Metabolic and Vascular Health at the University of Warwick, Judith Klein-Seetharaman, membrane protein expert from the University of Pittsburgh, USA. In an interdisciplinary approach combining computational and experimental studies, she looks at these proteins from both, structural and systems biology point of views. She proposes to study membrane protein folding by characterizing denatured states of the model system and G protein coupled receptor mammalian rhodopsin in molecular detail by predicting these states and experimentally validating them with biophysical approaches such as 19F NMR spectroscopy. She will extend these studies to mutant rhodopsins that cause the retinal degeneration disease Retinitis pigmentosa and that are known to misfold and to other membrane proteins, in particular carnitine palmitoyltransferase 1A, of particular interest to our division. She will also investigate interactions of proteins with lipids using coarse grained simulations and in a systems biology approach interactions with other proteins to define the human membrane receptor interactome by establishing new collaborations within the division and with the Chemistry department. In this approach, computational machine learning methods are used to integrate large –omics databases to predict what interactions are likely for any given membrane receptor and then test the predictions using surface plasmon resonance and the TOXCAT assay. She proposes to disseminate her results in lecture series, conferences, a website, journal publications and through implementation of a graduate course.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule lipides
- sciences naturelles sciences physiques optique spectroscopie spectrométrie d’absorption
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines repliement protéique
- sciences naturelles informatique et science de l'information intelligence artificielle apprentissage automatique
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2013-IIF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
CV4 8UW COVENTRY
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.