Objectif
DNA double-strand breaks (DSBs) in our genome that are not repaired properly can lead to various developmental, immunological, and neurological disorders and are a major driver for genomic instability and tumorigenesis. The role of chromatin accessibility is of key importance to understand how the DNA/chromatin template senses and amplifies the DNA damage signal to properly repair the DNA in its native context. While all cells employ mechanisms for repairing DSBs, lymphocytes have uniquely adapted the same repair pathways for generating antibody diversity. During an immune response, B-lymphocytes undergo physiological DNA damage initiated by the activated-induced cytidine deaminase (AID) in a DNA rearrangement reaction called immunoglobulin heavy-chain (IgH) class-switch recombination (CSR). If AID-induced DNA breaks are not properly resolved, this B cell-specific DNA damage can lead to the formation of oncogenic chromosomal translocations; however, it is poorly understood how chromatin-associated factors coordinate this recombination reaction to suppress genomic instability. Here, I propose to use a novel approach combining chromatin immunoprecipitation and mouse genetics with state-of-the-art mass spectrometry-based label-free quantitative proteomics to identify and elucidate chromatin-bound proteins at DSBs. I will define the protein landscapes at DSBs in response to both γ-IR- and AID-induced DNA damage, based on our preliminary data, with unprecedented resolution and statistical confidence. I will perform detailed functional characterization of a subset of proteins using complementary approaches that investigate the repair of IR- and AID-induced DNA damage in lymphocytes. These combined unbiased proteomic and focused cell-based studies will deepen our understanding of the role of chromatin in the DNA damage response and DSB repair and may provide relevant targets for rationale design of therapeutic strategies for cancer or immunodeficiency disease.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale immunologie
- sciences médicales et de la santé médecine clinique oncologie
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale neurologie
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2013-IEF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
1165 KOBENHAVN
Danemark
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.