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Contenuto archiviato il 2024-06-18

Identifying Functional Proteins at DNA Breaks with Quantitative Proteomics in Primary Lymphocytes

Obiettivo

DNA double-strand breaks (DSBs) in our genome that are not repaired properly can lead to various developmental, immunological, and neurological disorders and are a major driver for genomic instability and tumorigenesis. The role of chromatin accessibility is of key importance to understand how the DNA/chromatin template senses and amplifies the DNA damage signal to properly repair the DNA in its native context. While all cells employ mechanisms for repairing DSBs, lymphocytes have uniquely adapted the same repair pathways for generating antibody diversity. During an immune response, B-lymphocytes undergo physiological DNA damage initiated by the activated-induced cytidine deaminase (AID) in a DNA rearrangement reaction called immunoglobulin heavy-chain (IgH) class-switch recombination (CSR). If AID-induced DNA breaks are not properly resolved, this B cell-specific DNA damage can lead to the formation of oncogenic chromosomal translocations; however, it is poorly understood how chromatin-associated factors coordinate this recombination reaction to suppress genomic instability. Here, I propose to use a novel approach combining chromatin immunoprecipitation and mouse genetics with state-of-the-art mass spectrometry-based label-free quantitative proteomics to identify and elucidate chromatin-bound proteins at DSBs. I will define the protein landscapes at DSBs in response to both γ-IR- and AID-induced DNA damage, based on our preliminary data, with unprecedented resolution and statistical confidence. I will perform detailed functional characterization of a subset of proteins using complementary approaches that investigate the repair of IR- and AID-induced DNA damage in lymphocytes. These combined unbiased proteomic and focused cell-based studies will deepen our understanding of the role of chromatin in the DNA damage response and DSB repair and may provide relevant targets for rationale design of therapeutic strategies for cancer or immunodeficiency disease.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-2013-IEF
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinatore

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Contributo UE
€ 230 809,80
Indirizzo
NORREGADE 10
1165 KOBENHAVN
Danimarca

Mostra sulla mappa

Regione
Danmark Hovedstaden Byen København
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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