Ziel
This proposal concerns the development of new solid-state NMR methods using proton detection under Magic Angle Spinning (MAS) with frequencies up to 100 kHz. The 100 kHz MAS probe head is a prototype and will allow significant gains in sensitivity by scaling down the 1H-1H dipolar coupling interaction and resulting in narrow proton line width down to 10-20 Hz. Small quantities of protein samples in the range of 0.3 to 0.5 mg allow a signal-to noise ratio that exceeds that of tens of mg in a bigger rotor at lower MAS frequency.
A focus of this proposal is the development and optimization of methods to reliably determine backbone dynamics in the solid state under 100 kHz MAS condition, based on 15N R1 and R1ρ relaxation rates as well as transverse 15N CSA/ NH dipolar cross-correlated relaxation rates and NH dipolar couplings that are sensitive up to the microsecond time scale. The experimental analysis will be supported by spin dynamics simulations. 15N T2 relaxation measurements remain a challenging task, as significant differences between bulk T2 measurements using a spin-echo sequence and T1ρ measurements show. We want to compare those measurements at 100 kHz MAS and rationalize systematic differences by spin dynamics simulations.
Second, bulk T2 decay times will be estimated for different in- and anti-phase coherences, present in higher-dimensional backbone spectral assignment experiments. Scalar coupling-based INEPT and CP-based polarization transfers will be compared in terms of efficiency. Aim is to minimize loss of magnetization during transfer steps with unfavorable T2 decay properties or insufficient dipolar transfer efficiency and to design an optimized set of experiments for backbone assignment at fast MAS.
Methods will be developed on the small protein ubiquitin, a well-studied model system, with the aim of transferring it to a membrane protein, e.g. the HIV viral protein envelope protein gp41.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Gesundheitswissenschaften Infektionskrankheit RNS-Virus HIV
- Naturwissenschaften Naturwissenschaften Elektromagnetismus und Elektronik Spintronik
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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FP7-PEOPLE-2013-IEF
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
8092 Zuerich
Schweiz
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.