Objetivo
Given our limited ability to rationally design proteins to our needs, their supply for biotechnological solutions leading to a sustainable Bioeconomy is relying on proteins found in nature and methods for deriving improved versions. Proteins evolved their structure to fulfil certain functions in very specific niches, but these do not resemble optimal properties in the new context of biotechnological applications. Hence, improving the activity, affinity and stability of a protein is key, but technologically challenging. The current methods for improving proteins through directed evolution require intense human intervention and are limited in their ability to sample sequence space beyond single and double mutations. This project will establish a novel system, in which the whole process of mutation and selection takes place in vivo inside an E. coli host, and can be controlled through a genetic network designed using a Synthetic Biology approach. It will allow for the exploration of a larger sequence space during the evolutionary process, while controlling mutagenesis rate and selection stringency. Our preliminary data demonstrates a groundbreaking novel method to target mutagenesis in vivo. I will extend its mutation diversity by recruiting engineered error prone polymerases to the site of the targeted DNA damage. Using a SynBio approach, I will develop a control circuitry, which will stop the targeted mutagenesis activity, once a variant fulfils the selection criteria. While protecting the identity of the selected sequence, it will mark the successful cell by expression of a fluorescent reporter for selection. In a prototype application I will generate variants of the Quorum Sensing transcription factor, LuxR, with high affinities to different signalling molecules – a potential toolset for orthogonal cellular signalling applications in industrially relevant co-cultures. The resulting directed evolution system will be readily adaptable to different proteins.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas biología sintética
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas biología evolutiva
- ciencias naturales ciencias biológicas genética mutación
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP7-PEOPLE-2013-IEF
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Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
SW7 2AZ London
Reino Unido
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.