Obiettivo
Given our limited ability to rationally design proteins to our needs, their supply for biotechnological solutions leading to a sustainable Bioeconomy is relying on proteins found in nature and methods for deriving improved versions. Proteins evolved their structure to fulfil certain functions in very specific niches, but these do not resemble optimal properties in the new context of biotechnological applications. Hence, improving the activity, affinity and stability of a protein is key, but technologically challenging. The current methods for improving proteins through directed evolution require intense human intervention and are limited in their ability to sample sequence space beyond single and double mutations. This project will establish a novel system, in which the whole process of mutation and selection takes place in vivo inside an E. coli host, and can be controlled through a genetic network designed using a Synthetic Biology approach. It will allow for the exploration of a larger sequence space during the evolutionary process, while controlling mutagenesis rate and selection stringency. Our preliminary data demonstrates a groundbreaking novel method to target mutagenesis in vivo. I will extend its mutation diversity by recruiting engineered error prone polymerases to the site of the targeted DNA damage. Using a SynBio approach, I will develop a control circuitry, which will stop the targeted mutagenesis activity, once a variant fulfils the selection criteria. While protecting the identity of the selected sequence, it will mark the successful cell by expression of a fluorescent reporter for selection. In a prototype application I will generate variants of the Quorum Sensing transcription factor, LuxR, with high affinities to different signalling molecules – a potential toolset for orthogonal cellular signalling applications in industrially relevant co-cultures. The resulting directed evolution system will be readily adaptable to different proteins.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biologia sintetica
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze biologiche biologia evoluzionistica
- scienze naturali scienze biologiche genetica mutazione
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP7-PEOPLE-2013-IEF
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
SW7 2AZ London
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.