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Contenuto archiviato il 2024-06-16

Assessment of the accuracy of different phylogenetic methods for HIV-1 contact tracing and HIV-1 molecular epidemiology in Greece

Obiettivo

HIV-1 is one of the most genetically variable human pathogens. Given this extremely high evolutionary rate of the virus, we can trace the recent spread of the HIV-1 epidemic using molecular data. Phylogenetic analyses have been used in monitoring the molec ular epidemiology of HIV-1 at a global scale, within single countries and risk groups, or for the investigation of the HIV-1 transmission in several cases of uncertain histories. The accuracy of different phylogenetic methods, to truly reconstruct HIV-1 ep idemiological relationships, has been previously investigated by analyzing DNA sequences from patients, for which the transmission events and dates were accurately known. (HIV-1 Swedish transmission chain) Although analyses of DNA sequences isolated from p atients infected from a single source (transmission chains) provide valuable information about the evolution of the virus after sequential transmissions, as well as about the levels of concordance between the evolutionary tree and the transmission tree; th ey don¿t provide evidence about the ability of different phylogenetic methods to truly reconstruct potential clusters of epidemiologically closely linked patients within a population. It is our objective to address the latter question, by analyzing HIV-1 s equences isolated from individuals, for which the close epidemiological link has been independently documented, including also sequences from diverse origin; thus searching for the optimal methodology for HIV-1 contact tracing. Moreover, we will perform a molecular epidemiology study of HIV-1 infection in Greece; investigating how the epidemic spreads among and within different transmission risk groups, and inferring the intermixing (migration) rates of viral infection between the Greek residents and immigr ants or contacts from Africa, Europe, or other geographic areas, and vice versa.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP6-2002-MOBILITY-11
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

ERG - Marie Curie actions-European Re-integration Grants

Coordinatore

NATIONAL AND KAPODISTRIAN UNIVERSITY OF ATHENS
Contributo UE
Nessun dato
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato
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