Descripción del proyecto
El papel de los ARN no codificantes en el desarrollo de las plantas
El desarrollo de las plantas es un proceso complejo que implica la expresión coordinada de genes que controlan diversos aspectos del crecimiento y el desarrollo. Una clase importante de genes que participan en este proceso son las pequeñas moléculas de ARN que no codifican proteínas, pero desempeñan importantes funciones reguladoras de la expresión génica. El equipo del proyecto sRNA-EMB, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, utilizará «Arabidopsis thaliana» como sistema modelo para estudiar de qué modo los pequeños ARN regulan el desarrollo de los embriones vegetales y su epigenoma. Los investigadores se centrarán en la interacción de pequeños ARN con genes específicos en distintos tipos de células durante el desarrollo embrionario y aportarán importantes conocimientos sobre el papel de los ARN no codificantes en la biología reproductiva de las plantas.
Objetivo
Small RNAs are short non-coding RNAs that regulate gene expression in plants and animals. Although small RNAs are essential for proper differentiation and epigenome regulation, little is known regarding their embryonic functions, especially in plants. Arabidopsis thaliana is a leading system to study the regulatory roles of small RNAs because of the abundance of genetic, genomic and epigenomic resources. Moreover, Arabidopsis embryos undergo invariant division patterns and rapidly differentiate to generate the most basic plant cell-types arranged in correct positions. Early Arabidopsis embryos are therefore morphologically simple structures composed of diverse cell types making them ideal for determining the influence of small RNAs on fundamental cellular differentiation and reprogramming events. The objectives of the proposed research are designed to assess the regulatory roles of small RNAs in establishing both the basic body plan and epigenome in plant embryos. We will utilize modified next-generation sequencing technologies to identify small RNAs present in developing embryos. Because we will generate these RNA profiles from a mixture of cell-types, we will also use a fluorescent protein-based approach to quantify specific miRNA repressive activities in individual cell-types. To determine the functions of individual miRNA/target interactions during embryogenesis, we will identify miRNAs required for embryo development and use genome-wide approaches to study specific miRNA/target interactions in greater detail. Lastly, we will use a fusion of genetic and genomic methods to determine how small RNAs influence the nascent epigenome during early embryogenesis.
Ámbito científico
Programa(s)
Régimen de financiación
ERC-STG - Starting GrantInstitución de acogida
1030 Wien
Austria