Unravelling cross-presentation pathways using a chemical biology approach

Informations projet

Crosstag

N° de convention de subvention: 639005

DOI

10.3030/639005

Projet clôturé

Date de signature de la CE 11 Mars 2015

Date de début 1 Mai 2015

Date de fin 30 Avril 2020

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 500 000,00

Contribution de l’UE

€ 1 500 000,00

Coordonné par

UNIVERSITEIT LEIDEN
Netherlands

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Publications

Peer reviewed articles (19)

Negatively Charged Lipid Membranes Catalyze Supramolecular Hydrogel Formation

Auteurs: Frank Versluis, Daphne M. van Elsland, Serhii Mytnyk, Dayinta L. Perrier, Fanny Trausel, Jos M. Poolman, Chandan Maity, Vincent A. A. le Sage, Sander I. van Kasteren, Jan H. van Esch, Rienk Eelkema
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 138/28, 2016, Page(s) 8670-8673, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.6b03853

The Optimization of Bioorthogonal Epitope Ligation within MHC-I Complexes

Auteurs: Joanna B. Pawlak, Brett J. Hos, Michel J. van de Graaff, Otty A. Megantari, Nico Meeuwenoord, Herman S. Overkleeft, Dmitri V. Filippov, Ferry Ossendorp, Sander I. van Kasteren
Publié dans: ACS Chemical Biology, Numéro 11/11, 2016, Page(s) 3172-3178, ISSN 1554-8929
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acschembio.6b00498

Lymphocryptovirus Infection of Nonhuman Primate B Cells Converts Destructive into Productive Processing of the Pathogenic CD8 T Cell Epitope in Myelin Oligodendrocyte Glycoprotein

Auteurs: S. Anwar Jagessar, Inge R. Holtman, Sam Hofman, Elena Morandi, Nicole Heijmans, Jon D. Laman, Bruno Gran, Bart W. Faber, Sander I. van Kasteren, Bart J. L. Eggen, Bert A. ‘t Hart
Publié dans: The Journal of Immunology, Numéro 197/4, 2016, Page(s) 1074-1088, ISSN 0022-1767
Éditeur: American Association of Immunologists
DOI: 10.4049/jimmunol.1600124

Detection of bioorthogonal groups by correlative light and electron microscopy allows imaging of degraded bacteria in phagocytes

Auteurs: Daphne M. van Elsland, Erik Bos, Wouter de Boer, Herman S. Overkleeft, Abraham J. Koster, Sander I. van Kasteren
Publié dans: Chem. Sci., Numéro 7/1, 2016, Page(s) 752-758, ISSN 2041-6520
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/C5SC02905H

Bioorthogonal Deprotection on the Dendritic Cell Surface for Chemical Control of Antigen Cross-Presentation

Auteurs: Joanna B. Pawlak, Geoffroy P. P. Gential, Tracy J. Ruckwardt, Jessica S. Bremmers, Nico J. Meeuwenoord, Ferry A. Ossendorp, Herman S. Overkleeft, Dmitri V. Filippov, Sander I. van Kasteren
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 54/19, 2015, Page(s) 5628-5631, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.201500301

Quantification of Bioorthogonal Stability in Immune Phagocytes Using Flow Cytometry Reveals Rapid Degradation of Strained Alkynes

Auteurs: Thomas Bakkum, Tyrza van Leeuwen, Alexi J. C. Sarris, Daphne M. van Elsland, Dimitrios Poulcharidis, Herman S. Overkleeft, Sander I. van Kasteren
Publié dans: ACS Chemical Biology, Numéro 13/5, 2018, Page(s) 1173-1179, ISSN 1554-8929
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acschembio.8b00355

Imaging Bioorthogonal Groups in Their Ultrastructural Context with Electron Microscopy

Auteurs: Daphne M. van Elsland, Sander I. van Kasteren
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 55/33, 2016, Page(s) 9472-9473, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.201604672

A flow cytometry assay to quantify intercellular exchange of membrane components

Auteurs: Dimitrios Poulcharidis, Kimberley Belfor, Alexander Kros, Sander I. van Kasteren
Publié dans: Chemical Science, Numéro 8/8, 2017, Page(s) 5585-5590, ISSN 2041-6520
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c7sc00260b

Chemical Tools for Studying TLR Signaling Dynamics

Auteurs: Timo Oosenbrug, Michel J. van de Graaff, Maaike E. Ressing, Sander I. van Kasteren
Publié dans: Cell Chemical Biology, Numéro 24/7, 2017, Page(s) 801-812, ISSN 2451-9456
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.chembiol.2017.05.022

Going Native: Synthesis of Glycoproteins and Glycopeptides via Native Linkages To Study Glycan-Specific Roles in the Immune System

Auteurs: Mikkel H. S. Marqvorsen, Can Araman, Sander I. van Kasteren
Publié dans: Bioconjugate Chemistry, Numéro 30/11, 2019, Page(s) 2715-2726, ISSN 1043-1802
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.bioconjchem.9b00588

Amyloid-like Behavior of Site-Specifically Citrullinated Myelin Oligodendrocyte Protein (MOG) Peptide Fragments inside EBV-Infected B-Cells Influences Their Cytotoxicity and Autoimmunogenicity

Auteurs: Can Araman, Miriam E. van Gent, Nico J. Meeuwenoord, Nicole Heijmans, Mikkel H. S. Marqvorsen, Ward Doelman, Bart W. Faber, Bert A. ’t Hart, Sander I. Van Kasteren
Publié dans: Biochemistry, Numéro 58/6, 2018, Page(s) 763-775, ISSN 0006-2960
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.biochem.8b00852

Ultrastructural Imaging of Salmonella -Host Interactions Using Super-resolution Correlative Light-Electron Microscopy of Bioorthogonal Pathogens

Auteurs: Daphne M. van Elsland, Sílvia Pujals, Thomas Bakkum, Erik Bos, Nikolaos Oikonomeas-Koppasis, Ilana Berlin, Jacques Neefjes, Annemarie H. Meijer, Abraham J. Koster, Lorenzo Albertazzi, Sander I. van Kasteren
Publié dans: ChemBioChem, Numéro 19/16, 2018, Page(s) 1766-1770, ISSN 1439-4227
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.201800230

Localization of active endogenous and exogenous β‐glucocerebrosidase by correlative light‐electron microscopy in human fibroblasts

Auteurs: Eline van Meel, Erik Bos, Martijn J. C. van der Lienden, Herman S. Overkleeft, Sander I. van Kasteren, Abraham J. Koster, Johannes M. F. G. Aerts
Publié dans: Traffic, Numéro 20/5, 2019, Page(s) 346-356, ISSN 1398-9219
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/tra.12641

Immunoproteasome Inhibitor–Doxorubicin Conjugates Target Multiple Myeloma Cells and Release Doxorubicin upon Low-Dose Photon Irradiation

Auteurs: Elmer Maurits, Michel J. van de Graaff, Santina Maiorana, Dennis P. A. Wander, Patrick M. Dekker, Sabina Y. van der Zanden, Bogdan I. Florea, Jacques J. C. Neefjes, Herman S. Overkleeft, Sander I. van Kasteren
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 142/16, 2020, Page(s) 7250-7253, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.9b11969

Fluorogenic Bifunctional trans ‐Cyclooctenes as Efficient Tools for Investigating Click‐to‐Release Kinetics

Auteurs: Mark A. R. Geus, Elmer Maurits, Alexi J. C. Sarris, Thomas Hansen, Max S. Kloet, Kiki Kamphorst, Wolter Hoeve, Marc S. Robillard, Andrea Pannwitz, Sylvestre A. Bonnet, Jeroen D. C. Codée, Dmitri V. Filippov, Herman S. Overkleeft, Sander I. Kasteren
Publié dans: Chemistry – A European Journal, Numéro 26/44, 2020, Page(s) 9900-9904, ISSN 0947-6539
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/chem.201905446

Conditionally Controlling Human TLR2 Activity via Trans-Cyclooctene Caged Ligands

Auteurs: Michel J. van de Graaff, Timo Oosenbrug, Mikkel H. S. Marqvorsen, Clarissa R. Nascimento, Mark A. R. de Geus, Bénédicte Manoury, Maaike E. Ressing, Sander I. van Kasteren
Publié dans: Bioconjugate Chemistry, Numéro 31/6, 2020, Page(s) 1685-1692, ISSN 1043-1802
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.bioconjchem.0c00237

Chemical Control over T-Cell Activation in Vivo Using Deprotection of trans -Cyclooctene-Modified Epitopes

Auteurs: Anouk M. F. van der Gracht, Mark A. R. de Geus, Marcel G. M. Camps, Tracy J. Ruckwardt, Alexi J. C. Sarris, Jessica Bremmers, Elmer Maurits, Joanna B. Pawlak, Michelle M. Posthoorn, Kimberly M. Bonger, Dmitri V. Filippov, Herman S. Overkleeft, Marc S. Robillard, Ferry Ossendorp, Sander I. van Kasteren
Publié dans: ACS Chemical Biology, Numéro 13/6, 2018, Page(s) 1569-1576, ISSN 1554-8929
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acschembio.8b00155

Efficient synthesis and enzymatic extension of an N -GlcNAz asparagine building block

Auteurs: Mikkel Haarslev Schröder Marqvorsen, Sivasinthujah Paramasivam, Ward Doelman, Antony John Fairbanks, Sander Izaäk van Kasteren
Publié dans: Chemical Communications, Numéro 55/36, 2019, Page(s) 5287-5290, ISSN 1359-7345
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c9cc02051a

Fast and pH‐Independent Elimination of trans ‐Cyclooctene by Using Aminoethyl‐Functionalized Tetrazines

Auteurs: Alexi J. C. Sarris, Thomas Hansen, Mark A. R. de Geus, Elmer Maurits, Ward Doelman, Herman S. Overkleeft, Jeroen D. C. Codée, Dmitri V. Filippov, Sander I. van Kasteren
Publié dans: Chemistry – A European Journal, Numéro 24/68, 2018, Page(s) 18075-18081, ISSN 0947-6539
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/chem.201803839