Mesoscopic models for propagation in biology

Projektinformationen

MESOPROBIO

ID Finanzhilfevereinbarung: 639638

DOI

10.3030/639638

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 31 März 2015

Startdatum 1 September 2015

Enddatum 31 August 2020

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 091 688,00

EU-Beitrag

€ 1 091 688,00

Koordiniert durch

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
France

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Veröffentlichungen

Other (8)

Nonlinear stability of chemotactic clustering with discontinuous advection

Autoren: Vincent Calvez, Franca Hoffmann
Veröffentlicht in: ARXIV, 2020
Herausgeber: arXiv
DOI: 10.48550/arXiv.2009.11048

The Cauchy problem for the infinitesimal model in the regime of small variance

Autoren: Florian Patout
Veröffentlicht in: 2020
Herausgeber: arXiv

Large deviations for velocity-jump processes and non-local Hamilton-Jacobi equations

Autoren: Bouin, Emeric; Calvez, Vincent; Grenier, Emmanuel; Nadin, Grégoire
Veröffentlicht in: https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01344939, 2019
Herausgeber: HAL archives-ouvertes

Non-local competition slows down front acceleration during dispersal evolution

Autoren: Vincent Calvez, Christopher Henderson, Sepideh Mirrahimi, Olga Turanova, Thierry Dumont
Veröffentlicht in: 2018
Herausgeber: arXiv

Chemotactic waves of bacteria at the mesoscale

Autoren: Vincent Calvez
Veröffentlicht in: 2016
Herausgeber: To appear in J. European Math Society

Influence of a mortality trade-off on the spreading rate of cane toads fronts

Autoren: Bouin , Emeric; Chan , Matthew H.; Henderson , Christopher; Kim , Peter S.
Veröffentlicht in: 2017, 2018
Herausgeber: To appear in Comm. Partial Differential Equations

Existence of recombination-selection equilibria for sexual populations

Autoren: Thibault Bourgeron, Vincent Calvez, Jimmy Garnier, Thomas Lepoutre
Veröffentlicht in: 2017
Herausgeber: arXiv

Long time evolutionary dynamics of phenotypically structured populations in time periodic environments

Autoren: FIGUEROA IGLESIAS , Susely; Mirrahimi , Sepideh
Veröffentlicht in: https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01727549, Ausgabe 2, 2018
Herausgeber: To appear in SIAM J. Math Analysis

Peer reviewed articles (25)

A note on hypocoercivity for kinetic equations with heavy-tailed equilibrium

Autoren: Nathalie Ayi, Maxime Herda, Hélène Hivert, Isabelle Tristani
Veröffentlicht in: Comptes Rendus. Mathématique, Ausgabe 358/3, 2020, Seite(n) 333-340, ISSN 1778-3569
Herausgeber: Académie des Sciences
DOI: 10.5802/crmath.46

Horizontal gene transfer: numerical comparison between stochastic and deterministic approaches

Autoren: Vincent Calvez, Susely Figueroa Iglesias, Hélène Hivert, Sylvie Méléard, Anna Melnykova, Samuel Nordmann
Veröffentlicht in: ESAIM: Proceedings and Surveys, Ausgabe 67, 2020, Seite(n) 135-160, ISSN 2267-3059
Herausgeber: SMAI
DOI: 10.1051/proc/202067009

Uniqueness of the viscosity solution of a constrained Hamilton–Jacobi equation

Autoren: Vincent Calvez, King-Yeung Lam
Veröffentlicht in: Calculus of Variations and Partial Differential Equations, Ausgabe 59/5, 2020, ISSN 0944-2669
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00526-020-01819-0

Inside dynamics for stage-structured integrodifference equations

Autoren: Nathan G. Marculis, Jimmy Garnier, Roger Lui, Mark A. Lewis
Veröffentlicht in: Journal of Mathematical Biology, Ausgabe 80/1-2, 2020, Seite(n) 157-187, ISSN 0303-6812
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00285-019-01378-9

A Hamilton–Jacobi method to describe the evolutionary equilibria in heterogeneous environments and with non-vanishing effects of mutations

Autoren: Sylvain Gandon, Sepideh Mirrahimi
Veröffentlicht in: Comptes Rendus Mathematique, Ausgabe 355/2, 2017, Seite(n) 155-160, ISSN 1631-073X
Herausgeber: Elsevier Masson
DOI: 10.1016/j.crma.2016.12.001

Super-linear spreading in local bistable cane toads equations

Autoren: Emeric Bouin, Christopher Henderson
Veröffentlicht in: Nonlinearity, Ausgabe 30/4, 2017, Seite(n) 1356-1375, ISSN 0951-7715
Herausgeber: Institute of Physics Publishing
DOI: 10.1088/1361-6544/aa5d65

Blow-Up Phenomena for Gradient Flows of Discrete Homogeneous Functionals

Autoren: Vincent Calvez, Thomas O. Gallouët
Veröffentlicht in: Applied Mathematics & Optimization, 2017, ISSN 0095-4616
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00245-017-9443-z

Traveling wave and aggregation in a flux-limited Keller-Segel model

Autoren: Vincent Calvez, Benoȋt Perthame, Shugo Yasuda
Veröffentlicht in: Kinetic & Related Models, Ausgabe 11/4, 2018, Seite(n) 891-909, ISSN 1937-5077
Herausgeber: AIMS
DOI: 10.3934/krm.2018035

Spreading in kinetic reaction–transport equations in higher velocity dimensions

Autoren: EMERIC BOUIN, NILS CAILLERIE
Veröffentlicht in: European Journal of Applied Mathematics, 2018, Seite(n) 1-29, ISSN 0956-7925
Herausgeber: Cambridge University Press
DOI: 10.1017/S0956792518000037

The Bramson logarithmic delay in the cane toads equations

Autoren: Emeric Bouin, Christopher Henderson, Lenya Ryzhik
Veröffentlicht in: Quarterly of Applied Mathematics, Ausgabe 75/4, 2017, Seite(n) 599-634, ISSN 0033-569X
Herausgeber: Brown University
DOI: 10.1090/qam/1470

Travelling Chemotactic Aggregates at Mesoscopic Scale and BiStability

Autoren: Vincent Calvez, Laurent Gosse, Monika Twarogowska
Veröffentlicht in: SIAM Journal on Applied Mathematics, Ausgabe 77/6, 2017, Seite(n) 2224-2249, ISSN 0036-1399
Herausgeber: Society for Industrial and Applied Mathematics
DOI: 10.1137/16M1108108

A Hamilton–Jacobi approach to characterize the evolutionary equilibria in heterogeneous environments

Autoren: Sepideh Mirrahimi
Veröffentlicht in: Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, Ausgabe 27/13, 2017, Seite(n) 2425-2460, ISSN 0218-2025
Herausgeber: World Scientific Publishing Co
DOI: 10.1142/S0218202517500488

Beneficial mutation-selection dynamics in finite asexual populations: a free boundary approach

Autoren: Lionel Roques, Jimmy Garnier, Guillaume Martin
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 7/1, 2017, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-017-17212-5

A first-order asymptotic preserving scheme for front propagation in a one-dimensional kinetic reaction–transport equation

Autoren: Hélène Hivert
Veröffentlicht in: Journal of Computational Physics, Ausgabe 367, 2018, Seite(n) 253-278, ISSN 0021-9991
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jcp.2018.04.036

Thin Front Limit of an Integro-differential Fisher-KPP Equation with Fat-Tailed Kernels

Autoren: Emeric Bouin, Jimmy Garnier, Christopher Henderson, Florian Patout
Veröffentlicht in: SIAM Journal on Mathematical Analysis, Ausgabe 50/3, 2018, Seite(n) 3365-3394, ISSN 0036-1410
Herausgeber: Society for Industrial and Applied Mathematics
DOI: 10.1137/17M1132501

Quantitative Convergence Towards a Self-Similar Profile in an Age-Structured Renewal Equation for Subdiffusion

Autoren: Hugues Berry, Thomas Lepoutre, Álvaro Mateos González
Veröffentlicht in: Acta Applicandae Mathematicae, Ausgabe 145/1, 2016, Seite(n) 15-45, ISSN 0167-8019
Herausgeber: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s10440-016-0048-3

Large deviations of a velocity jump process with a Hamilton–Jacobi approach

Autoren: Nils Caillerie
Veröffentlicht in: Comptes Rendus Mathematique, Ausgabe 355/2, 2017, Seite(n) 170-175, ISSN 1631-073X
Herausgeber: Elsevier Masson
DOI: 10.1016/j.crma.2016.12.011

Modeling Edar expression reveals the hidden dynamics of tooth signaling center patterning

Autoren: Alexa Sadier, Monika Twarogowska, Klara Steklikova, Luke Hayden, Anne Lambert, Pascal Schneider, Vincent Laudet, Maria Hovorakova, Vincent Calvez, Sophie Pantalacci
Veröffentlicht in: PLOS Biology, Ausgabe 17/2, 2019, Seite(n) e3000064, ISSN 1545-7885
DOI: 10.1371/journal.pbio.3000064

Limiting Hamilton–Jacobi equation for the large scale asymptotics of a subdiffusion jump-renewal equation

Autoren: Vincent Calvez, Pierre Gabriel, Álvaro Mateos González
Veröffentlicht in: Asymptotic Analysis, Ausgabe 115/1-2, 2019, Seite(n) 63-94, ISSN 0921-7134
Herausgeber: IOS Press
DOI: 10.3233/ASY-191528

Asymptotic analysis of a quantitative genetics model with nonlinear integral operator

Autoren: Vincent Calvez, Jimmy Garnier, Florian Patout
Veröffentlicht in: Journal de l’École polytechnique — Mathématiques, Ausgabe 6, 2019, Seite(n) 537-579, ISSN 2270-518X
DOI: 10.5802/jep.100

Catch Me If You Can: A Spatial Model for a Brake-Driven Gene Drive Reversal

Autoren: Léo Girardin, Vincent Calvez, Florence Débarre
Veröffentlicht in: Bulletin of Mathematical Biology, Ausgabe 81/12, 2019, Seite(n) 5054-5088, ISSN 0092-8240
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1007/s11538-019-00668-z

A mathematical model to investigate the key drivers of the biogeography of the colon microbiota

Autoren: Simon Labarthe, Bastien Polizzi, Thuy Phan, Thierry Goudon, Magali Ribot, Beatrice Laroche
Veröffentlicht in: Journal of Theoretical Biology, Ausgabe 462, 2019, Seite(n) 552-581, ISSN 0022-5193
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jtbi.2018.12.009

Singular limits for models of selection and mutations with heavy-tailed mutation distribution

Autoren: Sepideh Mirrahimi
Veröffentlicht in: Journal de Mathématiques Pures et Appliquées, Ausgabe 134, 2020, Seite(n) 179-203, ISSN 0021-7824
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.matpur.2019.10.001

Evolution of Specialization in Heterogeneous Environments: Equilibrium Between Selection, Mutation and Migration

Autoren: Sepideh Mirrahimi, Sylvain Gandon
Veröffentlicht in: Genetics, Ausgabe 214/2, 2020, Seite(n) 479-491, ISSN 0016-6731
Herausgeber: Genetics Society of America
DOI: 10.1534/genetics.119.302868

Propagation in a Fractional Reaction–Diffusion Equation in a Periodically Hostile Environment

Autoren: Alexis Léculier, Sepideh Mirrahimi, Jean-Michel Roquejoffre
Veröffentlicht in: Journal of Dynamics and Differential Equations, 2020, ISSN 1040-7294
Herausgeber: Plenum Publishers
DOI: 10.1007/s10884-020-09837-4

Book chapters (2)

The Geometry of Diffusing and Self-Attracting Particles in a One-Dimensional Fair-Competition Regime

Autoren: Vincent Calvez, José Antonio Carrillo, Franca Hoffmann
Veröffentlicht in: Nonlocal and Nonlinear Diffusions and Interactions: New Methods and Directions, 2017, Seite(n) 1-71
Herausgeber: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-319-61494-6_1

Concentration Waves of Chemotactic Bacteria: The Discrete Velocity Case

Autoren: Vincent Calvez, Laurent Gosse, Monika Twarogowska
Veröffentlicht in: Innovative Algorithms and Analysis, 2017, Seite(n) 79-109
Herausgeber: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-319-49262-9_3