Proteolytic processing in plant stress signal transduction and responses to abiotic stress and pathogen attack

Informazioni relative al progetto

ProPlantStress

ID dell’accordo di sovvenzione: 639905

DOI

10.3030/639905

Progetto chiuso

Data della firma CE 20 Maggio 2015

Data di avvio 1 Giugno 2015

Data di completamento 30 Novembre 2020

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 804 663,00

Contributo UE

€ 1 804 663,00

Coordinato da

FORSCHUNGSZENTRUM JULICH GMBH
Germany

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Pubblicazioni

Peer reviewed articles (13)

MANTI: Automated Annotation of Protein N-Termini for Rapid Interpretation of N-Terminome Data Sets

Autori: Fatih Demir, Jayachandran N. Kizhakkedathu, Markus M. Rinschen, Pitter F. Huesgen
Pubblicato in: Analytical Chemistry, Numero 93/13, 2021, Pagina/e 5596-5605, ISSN 0003-2700
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.1c00310

Abundance of metalloprotease FtsH12 modulates chloroplast development in Arabidopsis thaliana

Autori: Kati Mielke, Raik Wagner, Laxmi S Mishra, Fatih Demir, Andreas Perrar, Pitter F Huesgen, Christiane Funk
Pubblicato in: Journal of Experimental Botany, Numero online early, 2020, Pagina/e 1-18, ISSN 0022-0957
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/jxb/eraa550

Cutting the line: manipulation of plant immunity by bacterial type III effector proteases

Autori: Brian C Mooney, Melissa Mantz, Emmanuelle Graciet, Pitter F Huesgen
Pubblicato in: Journal of Experimental Botany, Numero 72/9, 2021, Pagina/e 3395-3409, ISSN 0022-0957
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/jxb/erab095

N-Degradomic Analysis Reveals a Proteolytic Network Processing the Podocyte Cytoskeleton

Autori: Markus M. Rinschen, Ann-Kathrin Hoppe, Florian Grahammer, Martin Kann, Linus A. Völker, Eva-Maria Schurek, Julie Binz, Martin Höhne, Fatih Demir, Milena Malisic, Tobias B. Huber, Christine Kurschat, Jayachandran N. Kizhakkedathu, Bernhard Schermer, Pitter F. Huesgen, Thomas Benzing
Pubblicato in: Journal of the American Society of Nephrology, Numero 28/10, 2017, Pagina/e 2867-2878, ISSN 1046-6673
Editore: Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
DOI: 10.1681/ASN.2016101119

Quantitative proteomics in plant protease substrate identification

Autori: Fatih Demir, Stefan Niedermaier, Joji Grace Villamor, Pitter Florian Huesgen
Pubblicato in: New Phytologist, Numero 218/3, 2018, Pagina/e 936-943, ISSN 0028-646X
Editore: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.14587

Positional proteomics for identification of secreted proteoforms released by site-specific processing of membrane proteins

Autori: Stefan Niedermaier, Pitter F. Huesgen
Pubblicato in: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics, Numero 1867, 2018, ISSN 1570-9639
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.bbapap.2018.09.004

New beginnings and new ends – Methods for large-scale characterization of protein termini and their use in plant biology

Autori: Andreas Perrar, Nico Dissmeyer, Pitter F Huesgen
Pubblicato in: Journal of Experimental Botany, Numero 70, 2019, Pagina/e 2021-2038, ISSN 0022-0957
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/jxb/erz104

A fungal substrate mimicking molecule suppresses plant immunity via an inter-kingdom conserved motif

Autori: Johana C. Misas Villamil, André N. Mueller, Fatih Demir, Ute Meyer, Bilal Ökmen, Jan Schulze Hüynck, Marlen Breuer, Helen Dauben, Joe Win, Pitter F. Huesgen, Gunther Doehlemann
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-09472-8

DEG10 contributes to mitochondrial proteostasis, root growth, and seed yield in Arabidopsis

Autori: Catharina V Huber, Barbara D Jakobs, Laxmi S Mishra, Stefan Niedermaier, Marc Stift, Gudrun Winter, Iwona Adamska, Christiane Funk, Pitter F Huesgen, Dietmar Funck
Pubblicato in: Journal of Experimental Botany, Numero 70, 2019, Pagina/e 5423-5436, ISSN 0022-0957
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/jxb/erz294

Sensitive Determination of Proteolytic Proteoforms in Limited Microscale Proteome Samples

Autori: Samuel S. H. Weng, Fatih Demir, Enes K. Ergin, Sabrina Dirnberger, Anuli Uzozie, Domenic Tuscher, Lorenz Nierves, Janice Tsui, Pitter F. Huesgen, Philipp F. Lange
Pubblicato in: Molecular & Cellular Proteomics, Numero 18/11, 2019, Pagina/e 2335-2347, ISSN 1535-9476
Editore: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1074/mcp.TIR119.001560

Photoprotective Acclimation of the Arabidopsis thaliana Leaf Proteome to Fluctuating Light

Autori: Stefan Niedermaier, Trang Schneider, Marc-Oliver Bahl, Shizue Matsubara, Pitter F. Huesgen
Pubblicato in: Frontiers in Genetics, Numero 11, 2020, ISSN 1664-8021
Editore: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fgene.2020.00154

ExteNDing Proteome Coverage with Legumain as a Highly Specific Digestion Protease

Autori: Wai Tuck Soh, Fatih Demir, Elfriede Dall, Andreas Perrar, Sven O. Dahms, Maithreyan Kuppusamy, Hans Brandstetter, Pitter F. Huesgen
Pubblicato in: Analytical Chemistry, Numero 92/4, 2020, Pagina/e 2961-2971, ISSN 0003-2700
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.9b03604

Structural and functional studies of Arabidopsis thaliana legumain beta reveal isoform specific mechanisms of activation and substrate recognition

Autori: Elfriede Dall, Florian B. Zauner, Wai Tuck Soh, Fatih Demir, Sven O. Dahms, Chiara Cabrele, Pitter F. Huesgen, Hans Brandstetter
Pubblicato in: Journal of Biological Chemistry, Numero 295/37, 2020, Pagina/e 13047-13064, ISSN 0021-9258
Editore: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1074/jbc.ra120.014478

Book chapters (1)

Profiling of Protein N-Termini and Their Modifications in Complex Samples

Autori: Fatih Demir, Stefan Niedermaier, Jayachandran N. Kizhakkedathu, Pitter F. Huesgen
Pubblicato in: Methods in Molecular Biology, Numero volume 1574, 2017, Pagina/e 35-50, ISBN 978-1-4939-6850-3
Editore: Springer New York
DOI: 10.1007/978-1-4939-6850-3_4

Non-peer reviewed articles (1)

Das maßgeschneiderte Proteom: Proteinmodifikation durch Proteolyse

Autori: Fatih Demir, Andreas Perrar, Pitter F. Huesgen
Pubblicato in: BIOspektrum, Numero 25/1, 2019, Pagina/e 41-44, ISSN 0947-0867
Editore: Spektrum Akademischer Verlag GmbH
DOI: 10.1007/s12268-019-1003-4