Ziel
Identification of the full complement of genes and other functional elements in any virus is crucial to fully understand its molecular biology and guide the development of effective control strategies. Our recent discoveries of new 'hidden' genes in the potyviruses, alphaviruses, arteriviruses, flaviviruses and influenza A virus have demonstrated that, even in the most well-studied and economically-important viruses, small overlapping genes can remain undetected throughout decades of research. Comparative computational analyses can be used to efficiently identify hidden features and target experimental analyses, thus saving time and cost, and minimizing animal experiments. With the rapid increase in sequencing data, for the first time it is now possible to map out at high resolution functional elements genome-wide in hundreds of important virus species.
Our research involves the development of powerful new tools for virus comparative genomics, and the application of these tools to uncover hidden genes and other functional elements in RNA virus and retrovirus genomes. Hidden genes are often translated via non-canonical mechanisms, such as programmed ribosomal frameshifting, and we are particularly interested in discovering and characterizing new types of non-canonical translation. Deciphering these 'exceptions-to-the-rule' enhances our understanding of the mechanics of protein synthesis. Further, these novel mechanisms may also be relevant to cellular gene expression.
The goals of this project are:
1) To computationally identify all 'hidden' genes and major functional non-coding elements in the genomes of RNA viruses and retroviruses of medical, veterinary and agricultural importance.
2) To experimentally characterize the most interesting new features.
3) To characterize novel translation mechanisms utilized by RNA viruses.
4) To develop web interfaces to our software and an interactive RNA virus comparative genomics database.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Gesundheitswissenschaften Infektionskrankheit RNS-Virus ebola
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- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Grundlagenmedizin Pharmakologie und Pharmazie Arzneimittel Impfstoff
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
ERC-COG - Consolidator Grant
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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(öffnet in neuem Fenster) ERC-2014-CoG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
CB2 1TN CAMBRIDGE
Vereinigtes Königreich
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