Objectif
A major goal in biology is to understand how gene regulatory information is encoded by the human genome and how it defines different gene expression programs and cell types. Enhancers are genomic elements that control transcription, yet despite their importance, only a minority of enhancers are known and functionally characterized. In particular, their activity changes during cellular signalling or cell type transitions are largely elusive. Furthermore, fundamental questions about transcriptional co-factors have remained unanswered even though they regulate enhancer activities and have become attractive therapeutic targets, e.g. for cancer treatment.
Here, I propose a functional genomics approach in mammalian cells with three specific objectives: First, we will identify and functionally characterize transcriptional enhancers in selected human and mouse cells using the recently developed quantitative enhancer activity assay STARR-seq. Second, we will determine enhancer activity changes quantitatively during steroid hormone signalling, cell differentiation, and malignant transformation to reveal enhancers that are important for these processes. Third, we will systematically dissect the functional relationship of enhancers and transcriptional co-factors.
This proposal uses emerging in-house technology to address fundamental questions in enhancer biology and complement the genome-wide profiling of gene expression and chromatin states (e.g. by ENCODE). We will gain insights into the genomic organization of active enhancers and reveal chromatin or sequence features associated with dynamic activity changes. I also expect that we will be able to define co-factor requirements for enhancer function and reveal if different types of enhancers exist. Given our expertise in experimental and computational approaches and STARR-seq, I anticipate that we reach our aims and make major contributions to the understanding of gene regulation in mammals.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biologie cellulaire signalisation cellulaire
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-COG - Consolidator Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2014-CoG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
1030 Wien
Autriche
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.