Obiettivo
The C-terminal domain (CTD) of the RNA polymerase II (RNAPII) largest subunit coordinates co-transcriptional processing and it is decorated by many processing factors throughout the transcription cycle. The composition of this supramolecular assembly is diverse and highly dynamic. Many of the factors associate with RNAPII weakly and transiently, and the association is dictated by different post-translational modification patterns and conformational changes of the CTD. To determine how these accessory factors assemble and exchange on the CTD of RNAPII has remained a major challenge. Here, we aim to unravel the structural and mechanistic bases for the dynamic assembly of RNAPII CTD with its processing factors.
Using NMR, we will determine high-resolution structures of several protein factors bound to the CTD carrying specific modifications. This will enable to decode how CTD modification patterns stimulate or prevent binding of a given processing factor. We will also establish the structural and mechanistic bases of proline isomerisation in the CTD that control the timing of isomer-specific protein-protein interactions. Next, we will combine NMR and SAXS approaches to unravel how the overall CTD structure is remodelled by binding of multiple copies of processing factors and how these factors cross-talk with each other. Finally, we will elucidate a mechanistic basis for the exchange of processing factors on the CTD.
Our study will answer the long-standing questions of how the overall CTD structure is modulated on binding to processing factors, and whether these factors cross-talk and compete with each other. The level of detail that we aim to achieve is currently not available for any transient molecular assemblies of such complexity. In this respect, the project will also provide knowledge and methodology for further studies of large and highly flexible molecular assemblies that still remain poorly understood.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
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Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
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ERC-COG - Consolidator Grant
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
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(si apre in una nuova finestra) ERC-2014-CoG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
601 77 Brno
Cechia
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.