Objectif
3' untranslated regions (3' UTRs) serve as a key platform in the RNA regulatory network that controls mRNA translational efficiency, localisation and stability. Of all human cell-types, brain-specific isoforms have the longest 3' UTRs and therefore their regulation is likely to be most complex. Moreover, mutations perturbing the mRNA secondary structure and sites of mRNA-miRNA interactions can lead to diseases such as neurodegeneration. Isoforms of variable 3' UTRs are engendered by alternative cleavage and polyadenylation (polyA) site selection. Of the many factors contributing to this process, both transcriptional and RNA regulatory interactions have been extensively studied. Yet the regulatory mechanisms responsible for the systematic tissue-specific polyA site selection remain largely unknown. Here I hypothesise that changes in transcription factors, RNA binding proteins, and polyA factors activities together regulate the condition-specificity of this process. Furthermore I hypothesise that the resulting 3' UTR sequence variation contributes to increased protein aggregation in neurodegenerative disorders such as motor neurone disease (MND), a common but incurable disorder in which mRNA metabolism and protein homeostasis are disrupted. Here using bioinformatic approaches I will integrate a variety of genomic measurements, and systematically identify tissue-specific transcriptional and post-transcriptional regulatory interactions underlying polyA site selection. I will develop linear models to characterise the genome-wide functional coupling between these regulatory interactions and study how these associate with MND in regulating alternative 3' UTRs. In doing this project I will not only advance our current knowledge about RNA regulation but I will enable a better understanding of the regulatory mechanisms underlying MND, and in the long term, the future development of new therapies that ameliorate the regulation of 3' UTRs in neurodegenerative diseases.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques neurobiologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale physiologie homéostasie
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale neurologie sclérose latérale amyotrophique
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2014
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
NW1 1AT London
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.