Obiettivo
3' untranslated regions (3' UTRs) serve as a key platform in the RNA regulatory network that controls mRNA translational efficiency, localisation and stability. Of all human cell-types, brain-specific isoforms have the longest 3' UTRs and therefore their regulation is likely to be most complex. Moreover, mutations perturbing the mRNA secondary structure and sites of mRNA-miRNA interactions can lead to diseases such as neurodegeneration. Isoforms of variable 3' UTRs are engendered by alternative cleavage and polyadenylation (polyA) site selection. Of the many factors contributing to this process, both transcriptional and RNA regulatory interactions have been extensively studied. Yet the regulatory mechanisms responsible for the systematic tissue-specific polyA site selection remain largely unknown. Here I hypothesise that changes in transcription factors, RNA binding proteins, and polyA factors activities together regulate the condition-specificity of this process. Furthermore I hypothesise that the resulting 3' UTR sequence variation contributes to increased protein aggregation in neurodegenerative disorders such as motor neurone disease (MND), a common but incurable disorder in which mRNA metabolism and protein homeostasis are disrupted. Here using bioinformatic approaches I will integrate a variety of genomic measurements, and systematically identify tissue-specific transcriptional and post-transcriptional regulatory interactions underlying polyA site selection. I will develop linear models to characterise the genome-wide functional coupling between these regulatory interactions and study how these associate with MND in regulating alternative 3' UTRs. In doing this project I will not only advance our current knowledge about RNA regulation but I will enable a better understanding of the regulatory mechanisms underlying MND, and in the long term, the future development of new therapies that ameliorate the regulation of 3' UTRs in neurodegenerative diseases.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze biologiche neurobiologia
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze biologiche genetica mutazione
- scienze mediche e della salute medicina di base fisiologia omeostasi
- scienze mediche e della salute medicina di base neurologia sclerosi laterale amiotrofica
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMMA PRINCIPALE
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2014
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
NW1 1AT London
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.