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Structure and function of repeat-derived non-coding RNAs in epigenetic regulation of mammalian pericentric heterochromatin

Ziel

A significant fraction of mammalian genomes is composed of repetitive elements, such as pericentric major satellite repeats. Repetitive elements present a critical challenge to genome stability because these regions are prone to recombination. To safeguard genome integrity, these repetitive sequences are maintained in an epigenetically silent heterochromatic state to prevent mutagenic recombination. A confounding enigma revealed by recent transcriptome-wide studies is that repetitive elements are actively transcribed into noncoding RNAs (ncRNAs). Furthermore, these repeat-derived transcripts are themselves important to maintain the heterochromatic structure at repetitive elements. Nevertheless, it appears that a certain balance must be achieved since overexpression of repeat-derived ncRNAs is a hallmark of the most common types of cancer. How repeat-derived ncRNAs function in epigenetic regulation of heterochromatin is poorly understood. In this proposed study, ncRNAs transcribed from mouse pericentric major satellite repeats will be investigated as a paradigm to understand the precise mechanism of how these ncRNAs regulate heterochromatin formation. The key element of the proposed study is characterizing the function of major satellite RNAs from a structural perspective. This is a novel and promising approach because the functions of RNA molecules are intimately linked with their ability to fold into complex structures. A possible scenario is that accurate folding of major satellite RNA directs the local recruitment of chromatin complexes to pericentric loci. To address this hypothesis, the proposed research programme aims to achieve the following: (i) determine the structure of major satellite RNAs; (ii) determine if major satellite RNAs are divided into functional domains and how this relates to the structure; and (iii) determine how the structure of major satellite RNAs influence their interaction with pericentric DNA and chromatin-associated proteins.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) H2020-MSCA-IF-2014

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 159 460,80
Adresse
HOFGARTENSTRASSE 8
80539 MUNCHEN
Deutschland

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Region
Bayern Oberbayern München, Kreisfreie Stadt
Aktivitätstyp
Research Organisations
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

€ 159 460,80
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