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Structure and function of repeat-derived non-coding RNAs in epigenetic regulation of mammalian pericentric heterochromatin

Obiettivo

A significant fraction of mammalian genomes is composed of repetitive elements, such as pericentric major satellite repeats. Repetitive elements present a critical challenge to genome stability because these regions are prone to recombination. To safeguard genome integrity, these repetitive sequences are maintained in an epigenetically silent heterochromatic state to prevent mutagenic recombination. A confounding enigma revealed by recent transcriptome-wide studies is that repetitive elements are actively transcribed into noncoding RNAs (ncRNAs). Furthermore, these repeat-derived transcripts are themselves important to maintain the heterochromatic structure at repetitive elements. Nevertheless, it appears that a certain balance must be achieved since overexpression of repeat-derived ncRNAs is a hallmark of the most common types of cancer. How repeat-derived ncRNAs function in epigenetic regulation of heterochromatin is poorly understood. In this proposed study, ncRNAs transcribed from mouse pericentric major satellite repeats will be investigated as a paradigm to understand the precise mechanism of how these ncRNAs regulate heterochromatin formation. The key element of the proposed study is characterizing the function of major satellite RNAs from a structural perspective. This is a novel and promising approach because the functions of RNA molecules are intimately linked with their ability to fold into complex structures. A possible scenario is that accurate folding of major satellite RNA directs the local recruitment of chromatin complexes to pericentric loci. To address this hypothesis, the proposed research programme aims to achieve the following: (i) determine the structure of major satellite RNAs; (ii) determine if major satellite RNAs are divided into functional domains and how this relates to the structure; and (iii) determine how the structure of major satellite RNAs influence their interaction with pericentric DNA and chromatin-associated proteins.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2014

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 159 460,80
Indirizzo
HOFGARTENSTRASSE 8
80539 MUNCHEN
Germania

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Regione
Bayern Oberbayern München, Kreisfreie Stadt
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 159 460,80
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