Ziel
Membrane-integral pyrophosphatases (M-PPases) couple cleavage of pyrophosphatase to pumping of ions across a membrane to generate membrane potential and play an important role in resistance to stressors. The solved structures of an H+-pumping M-PPase from Vigna radiata and an Na+-pumping M-PPase from Thermotoga maritima show M-PPases form a channel through the membrane, and this channel is plugged by an ion gate formed by three charged residues. Despite these structures, there are still many outstanding questions regarding M-PPases, especially in relation to H+ and Na+ dual-pumping M-PPases.
Bacteroides species are a major cause of anaerobic infections, and though they are part of a healthy human gut flora, when these bacteria escape the gut, they can cause bacteremia and abscess formation. Bacteroides species are associated with high antibiotic resistance rates and have a 19% or greater mortality rate. However, they do possess a possible drug target: an H+/Na+-pumping M-PPase.
A major goal of this project is to solve the structure of the Bacteroides vulgatus H+/Na+-pumping M-PPase to guide mutational studies to determine how M-PPases select for ions and to explore how the ion gate is opened and closed during ion pumping. Since the ion gate is closed in all M-PPase structures to date, I will also use single molecule fluorescence resonance energy transfer and total internal reflection fluorescence microscopy to determine the kinetics and conformational changes during ion gate movement. Finally, I will use molecular mechanics modeling to simulate ion gate function and design small-molecule drug candidates. Molecules that trap the ion gate in the open conformation will convert M-PPase into a pore in the membrane of Bacteroides species, leading to collapse of the membrane potential.
This project will further my career goal of pursuing research in bacterial pathogenesis from various perspectives, utilizing X-ray crystallography and single molecule technologies.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Mikrobiologie Bakteriologie
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
HAUPTPROGRAMM
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) H2020-MSCA-IF-2014
Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigenKoordinator
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LS2 9JT Leeds
Vereinigtes Königreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.