Investigating bacterial strain evolution through metagenomic genome assemblies

Información del proyecto

PopMet

Identificador del acuerdo de subvención: 660375

DOI

10.3030/660375

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 27 Febrero 2015

Fecha de inicio 1 Marzo 2015

Fecha de finalización 28 Febrero 2017

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coste total

€ 159 460,80

Aportación de la UE

€ 159 460,80

Coordinado por

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Germany

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Publicaciones

Peer reviewed articles (6)

Durable coexistence of donor and recipient strains after fecal microbiota transplantation

Autores: S. S. Li, A. Zhu, V. Benes, P. I. Costea, R. Hercog, F. Hildebrand, J. Huerta-Cepas, M. Nieuwdorp, J. Salojarvi, A. Y. Voigt, G. Zeller, S. Sunagawa, W. M. de Vos, P. Bork
Publicado en: Science, Edición 352/6285, 2016, Página(s) 586-589, ISSN 0036-8075
Editor: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aad8852

Disentangling type 2 diabetes and metformin treatment signatures in the human gut microbiota

Autores: Kristoffer Forslund, Falk Hildebrand, Trine Nielsen, Gwen Falony, Emmanuelle Le Chatelier, Shinichi Sunagawa, Edi Prifti, Sara Vieira-Silva, Valborg Gudmundsdottir, Helle Krogh Pedersen, Manimozhiyan Arumugam, Karsten Kristiansen, Anita Yvonne Voigt, Henrik Vestergaard, Rajna Hercog, Paul Igor Costea, Jens Roat Kultima, Junhua Li, Torben Jørgensen, Florence Levenez, Joël Dore, H. Bjørn Nielsen,
Publicado en: Nature, Edición 528/7581, 2015, Página(s) 262-266, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nature15766

Human gut microbes impact host serum metabolome and insulin sensitivity

Autores: Helle Krogh Pedersen, Valborg Gudmundsdottir, Henrik Bjørn Nielsen, Tuulia Hyotylainen, Trine Nielsen, Benjamin A. H. Jensen, Kristoffer Forslund, Falk Hildebrand, Edi Prifti, Gwen Falony, Emmanuelle Le Chatelier, Florence Levenez, Joel Doré, Ismo Mattila, Damian R. Plichta, Päivi Pöhö, Lars I. Hellgren, Manimozhiyan Arumugam, Shinichi Sunagawa, Sara Vieira-Silva, Torben Jørgensen, Jacob Bak
Publicado en: Nature, Edición 535/7612, 2016, Página(s) 376-381, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nature18646

Gut Microbiota Linked to Sexual Preference and HIV Infection

Autores: Noguera-Julian M, Rocafort M, Guillén Y, Rivera J, Casadellà M, Nowak P, Hildebrand F, Zeller G, Parera M, Bellido R, Rodríguez C, Carrillo J, Mothe B, Coll J, Bravo I, Estany C, Herrero C, Saz J, Sirera G, Torrela A, Navarro J, Crespo M, Brander C, Negredo E, Blanco J, Guarner F, Calle ML, Bork P, Sönnerborg A, Clotet B, Paredes R.
Publicado en: EBioMedicine, Edición Volume 5, 2016, Página(s) 135-146, ISSN 2352-3964
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ebiom.2016.01.032

RTK: efficient rarefaction analysis of large datasets

Autores: Paul Saary, Kristoffer Forslund, Peer Bork, Falk Hildebrand
Publicado en: Bioinformatics, 2017, ISSN 1367-4803
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btx206

Microbial, functional and viral gut metagenome shifts in early stage L-DOPA naive PD patients

Autores: Bedarf JR, Hildebrand F, Coelho LP, Sunagawa S, Bahram M, Goeser F, Bork P, Wuellner U
Publicado en: Genome Medicine, 2017, ISSN 1756-994X
Editor: BioMed Central